Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABRB2P47870 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABRB2P47870 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABRB2P47870 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABRB2P47870 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABRB2P47870 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GABRB2P47870 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GABRB2P47870 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GABRB2P47870 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GABRB2P47870 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GABRB2P47870 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GABRB2P47870 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GABRB2P47870 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GABRB2P47870 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABRB2P47870 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABRB2P47870 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABRB2P47870 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABRB2P47870 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABRB2P47870 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABRB2P47870 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABRB2P47870 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABRB2P47870 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABRB2P47870 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABRB2P47870 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABRB2P47870 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GABRB2P47870 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABRB2P47870 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABRB2P47870 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABRB2P47870 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABRB2P47870 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GABRB2P47870 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
GABRB2P47870 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GABRB2P47870 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GABRB2P47870 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GABRB2P47870 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GABRB2P47870 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GABRB2P47870 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GABRB2P47870 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GABRB2P47870 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GABRB2P47870 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GABRB2P47870 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GABRB2P47870 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GABRB2P47870 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABRB2P47870 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABRB2P47870 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABRB2P47870 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABRB2P47870 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GABRB2P47870 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GABRB2P47870 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABRB2P47870 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABRB2P47870 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABRB2P47870 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABRB2P47870 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABRB2P47870 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABRB2P47870 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABRB2P47870 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GABRB2P47870 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABRB2P47870 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABRB2P47870 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABRB2P47870 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABRB2P47870 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GABRB2P47870 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GABRB2P47870 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GABRB2P47870 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GABRB2P47870 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GABRB2P47870 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GABRB2P47870 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GABRB2P47870 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GABRB2P47870 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GABRB2P47870 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GABRB2P47870 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GABRB2P47870 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GABRB2P47870 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GABRB2P47870 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GABRB2P47870 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GABRB2P47870 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GABRB2P47870 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GABRB2P47870 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GABRB2P47870 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GABRB2P47870 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GABRB2P47870 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GABRB2P47870 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GABRB2P47870 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GABRB2P47870 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GABRB2P47870 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GABRB2P47870 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GABRB2P47870 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GABRB2P47870 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GABRB2P47870 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GABRB2P47870 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GABRB2P47870 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GABRB2P47870 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GABRB2P47870 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GABRB2P47870 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GABRB2P47870 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GABRB2P47870 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GABRB2P47870 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GABRB2P47870 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GABRB2P47870 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GABRB2P47870 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms