Protein–RNA interactions for Protein: P23396

RPS3, 40S ribosomal protein S3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3P23396 NDUFS3-209ENST00000531351 423 ntTSL 514.71□□□□□ -0.052e-10■■■■■ 38
RPS3P23396 CYB5R3-208ENST00000470741 3938 ntTSL 1 (best)13.1□□□□□ -0.317e-20■■■■■ 38
RPS3P23396 ESYT1-210ENST00000551790 540 ntTSL 412.36□□□□□ -0.432e-10■■■■■ 38
RPS3P23396 CYB5R3-202ENST00000361740 2938 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.647e-20■■■■■ 38
RPS3P23396 STAT5B-206ENST00000481517 999 ntTSL 49.83□□□□□ -0.844e-7■■■■■ 38
RPS3P23396 STAT5B-204ENST00000468496 897 ntTSL 56.03□□□□□ -1.444e-7■■■■■ 38
RPS3P23396 ATP5A1-213ENST00000590406 756 ntTSL 318.79■□□□□ 0.62e-9■■■■■ 38
RPS3P23396 LCP1-205ENST00000460190 765 ntTSL 25.76□□□□□ -1.497e-8■■■■■ 38
RPS3P23396 GART-216ENST00000487155 786 ntTSL 211.65□□□□□ -0.546e-8■■■■■ 37.9
RPS3P23396 UHRF1-202ENST00000613817 1859 ntTSL 221.1■□□□□ 0.971e-10■■■■■ 37.9
RPS3P23396 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.651e-10■■■■■ 37.9
RPS3P23396 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.111e-10■■■■■ 37.9
RPS3P23396 UHRF1-206ENST00000622802 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.471e-10■■■■■ 37.9
RPS3P23396 UHRF1-207ENST00000624301 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.631e-10■■■■■ 37.9
RPS3P23396 UHRF1-205ENST00000620565 3965 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.691e-10■■■■■ 37.9
RPS3P23396 UHRF1-201ENST00000612630 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.71e-10■■■■■ 37.9
RPS3P23396 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.772e-10■■■■■ 37.9
RPS3P23396 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.762e-10■■■■■ 37.9
RPS3P23396 TAF7-203ENST00000624761 603 ntTSL 419.71■□□□□ 0.752e-10■■■■■ 37.9
RPS3P23396 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.697e-8■■■■■ 37.9
RPS3P23396 BYSL-204ENST00000489290 1153 ntTSL 318.29■□□□□ 0.522e-10■■■■■ 37.9
RPS3P23396 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.447e-8■■■■■ 37.9
RPS3P23396 PIN4-202ENST00000373662 1094 ntTSL 316.91■□□□□ 0.34e-7■■■■■ 37.9
RPS3P23396 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.277e-8■■■■■ 37.9
RPS3P23396 TGM2-203ENST00000453095 693 ntTSL 412.95□□□□□ -0.342e-10■■■■■ 37.9
RPS3P23396 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.47e-8■■■■■ 37.9
RPS3P23396 RAE1-207ENST00000462438 3251 ntTSL 211.96□□□□□ -0.492e-10■■■■■ 37.9
RPS3P23396 HIGD1A-205ENST00000470543 983 ntTSL 211.72□□□□□ -0.537e-8■■■■■ 37.9
RPS3P23396 PSMD13-206ENST00000527047 1284 ntTSL 1 (best)11.61□□□□□ -0.552e-10■■■■■ 37.9
RPS3P23396 NDUFS2-206ENST00000473321 555 ntTSL 211.26□□□□□ -0.618e-9■■■■■ 37.9
RPS3P23396 PSMD13-209ENST00000529372 612 ntTSL 510.65□□□□□ -0.72e-10■■■■■ 37.9
RPS3P23396 PIN4-206ENST00000446576 776 ntTSL 39.26□□□□□ -0.934e-7■■■■■ 37.9
RPS3P23396 BYSL-202ENST00000372996 1299 ntTSL 59.21□□□□□ -0.942e-10■■■■■ 37.9
RPS3P23396 PSMD13-214ENST00000534590 787 ntTSL 59.21□□□□□ -0.942e-10■■■■■ 37.9
RPS3P23396 TAF7-202ENST00000624699 517 ntTSL 37.03□□□□□ -1.282e-10■■■■■ 37.9
RPS3P23396 AC099329.1-201ENST00000625589 539 ntTSL 54.92□□□□□ -1.627e-8■■■■■ 37.9
RPS3P23396 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.062e-16■■■■■ 37.9
RPS3P23396 YIF1B-210ENST00000589151 431 ntTSL 215.84■□□□□ 0.131e-8■■■■■ 37.8
RPS3P23396 ATP5A1-210ENST00000589869 910 ntTSL 314.06□□□□□ -0.163e-9■■■■■ 37.8
RPS3P23396 HP-215ENST00000569639 568 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.444e-7■■■■■ 37.7
RPS3P23396 HP-214ENST00000568417 280 ntTSL 411.72□□□□□ -0.534e-7■■■■■ 37.7
RPS3P23396 HP-206ENST00000562488 551 ntTSL 55.37□□□□□ -1.554e-7■■■■■ 37.7
RPS3P23396 DHRS7-203ENST00000553328 366 ntTSL 323.53■■□□□ 1.362e-13■■■■■ 37.7
RPS3P23396 DHRS7-210ENST00000557326 582 ntTSL 321.76■■□□□ 1.072e-13■■■■■ 37.7
RPS3P23396 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.682e-13■■■■■ 37.7
RPS3P23396 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.531e-6■■■■■ 37.7
RPS3P23396 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.252e-13■■■■■ 37.7
RPS3P23396 DHRS7-206ENST00000555171 563 ntTSL 216.19■□□□□ 0.182e-13■■■■■ 37.7
RPS3P23396 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.071e-6■■■■■ 37.7
RPS3P23396 DHRS7-208ENST00000557137 480 ntTSL 314.5□□□□□ -0.092e-13■■■■■ 37.7
RPS3P23396 DHRS7-207ENST00000556502 924 ntTSL 214.24□□□□□ -0.132e-13■■■■■ 37.7
RPS3P23396 DHRS7-205ENST00000554101 1361 ntTSL 214.14□□□□□ -0.152e-13■■■■■ 37.7
RPS3P23396 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.352e-13■■■■■ 37.7
RPS3P23396 PLA2G15-201ENST00000219345 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.421e-6■■■■■ 37.7
RPS3P23396 PLA2G15-203ENST00000444212 943 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.491e-6■■■■■ 37.7
RPS3P23396 PZP-203ENST00000539983 1504 ntTSL 210.44□□□□□ -0.744e-7■■■■■ 37.7
RPS3P23396 DHRS7-202ENST00000536410 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.742e-13■■■■■ 37.7
RPS3P23396 PZP-207ENST00000546197 1048 ntTSL 1 (best)8.6□□□□□ -1.034e-7■■■■■ 37.7
RPS3P23396 PZP-205ENST00000543108 580 ntTSL 48.4□□□□□ -1.064e-7■■■■■ 37.7
RPS3P23396 PZP-204ENST00000540995 483 ntTSL 37.6□□□□□ -1.194e-7■■■■■ 37.7
RPS3P23396 PZP-201ENST00000261336 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.264e-7■■■■■ 37.7
RPS3P23396 PZP-202ENST00000535230 4417 ntTSL 1 (best)6.79□□□□□ -1.324e-7■■■■■ 37.7
RPS3P23396 SYPL1-204ENST00000464029 1017 ntTSL 25.87□□□□□ -1.471e-6■■■■■ 37.7
RPS3P23396 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.733e-9■■■■■ 37.6
RPS3P23396 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.153e-9■■■■■ 37.6
RPS3P23396 SUPT4H1-205ENST00000581166 1401 ntTSL 213.64□□□□□ -0.233e-9■■■■■ 37.6
RPS3P23396 SUPT4H1-203ENST00000579289 318 ntTSL 310.37□□□□□ -0.753e-9■■■■■ 37.6
RPS3P23396 SUPT4H1-204ENST00000580947 574 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.24□□□□□ -0.773e-9■■■■■ 37.6
RPS3P23396 MCM2-202ENST00000468414 1076 ntTSL 211.84□□□□□ -0.511e-6■■■■■ 37.6
RPS3P23396 APOH-202ENST00000577982 707 ntTSL 53.81□□□□□ -1.81e-52■■■■■ 37.5
RPS3P23396 HIST4H4-205ENST00000540565 577 ntTSL 311.97□□□□□ -0.496e-13■■■■■ 37.5
RPS3P23396 NDUFB5-204ENST00000471112 684 ntTSL 35.94□□□□□ -1.461e-8■■■■■ 37.5
RPS3P23396 OAT-206ENST00000490096 579 ntTSL 58.56□□□□□ -1.044e-7■■■■■ 37.5
RPS3P23396 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.365e-7■■■■■ 37.5
RPS3P23396 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.335e-7■■■■■ 37.5
RPS3P23396 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.335e-7■■■■■ 37.5
RPS3P23396 YIF1B-206ENST00000586319 936 ntTSL 316.96■□□□□ 0.312e-7■■■■■ 37.4
RPS3P23396 SSR4-211ENST00000486204 658 ntTSL 312.62□□□□□ -0.396e-7■■■■■ 37.4
RPS3P23396 SSR4-210ENST00000485612 701 ntTSL 211.51□□□□□ -0.576e-7■■■■■ 37.4
RPS3P23396 SAA2-SAA4-201ENST00000524555 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.442e-9■■■■■ 37.4
RPS3P23396 SAA4-201ENST00000278222 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.682e-9■■■■■ 37.4
RPS3P23396 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.566e-8■■■■■ 37.4
RPS3P23396 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.336e-8■■■■■ 37.4
RPS3P23396 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.326e-8■■■■■ 37.4
RPS3P23396 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.916e-8■■■■■ 37.4
RPS3P23396 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.636e-8■■■■■ 37.4
RPS3P23396 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.626e-8■■■■■ 37.4
RPS3P23396 TSPAN4-210ENST00000464987 2205 ntTSL 518.39■□□□□ 0.546e-8■■■■■ 37.4
RPS3P23396 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.296e-8■■■■■ 37.4
RPS3P23396 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.276e-8■■■■■ 37.4
RPS3P23396 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.26e-8■■■■■ 37.4
RPS3P23396 TSPAN4-218ENST00000529566 706 ntTSL 215.74■□□□□ 0.116e-8■■■■■ 37.4
RPS3P23396 TSPAN4-211ENST00000468468 2777 ntTSL 215.43■□□□□ 0.066e-8■■■■■ 37.4
RPS3P23396 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.056e-8■■■■■ 37.4
RPS3P23396 TSPAN4-220ENST00000532375 518 ntTSL 513.62□□□□□ -0.236e-8■■■■■ 37.4
RPS3P23396 TMEM9-211ENST00000497582 1075 ntTSL 321.67■■□□□ 1.063e-8■■■■■ 37.3
RPS3P23396 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.693e-8■■■■■ 37.3
RPS3P23396 ARHGAP19-207ENST00000493068 812 ntTSL 211.08□□□□□ -0.642e-6■■■■■ 37.3
RPS3P23396 LDHA-222ENST00000543695 554 ntTSL 511.15□□□□□ -0.629e-13■■■■■ 37.3
RPS3P23396 MCM2-209ENST00000491422 2844 ntTSL 513.36□□□□□ -0.272e-6■■■■■ 37.3
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