RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529566.1

TSPAN4-218, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 706 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-218ENST00000529566 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.3■■■■□ 3.88
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TSPAN4-218ENST00000529566 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.83■■■□□ 2.85
TSPAN4-218ENST00000529566 NACADO15069 1562 aa32.83■■■□□ 2.85
TSPAN4-218ENST00000529566 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.8■■■□□ 2.84
TSPAN4-218ENST00000529566 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.73■■■□□ 2.83
TSPAN4-218ENST00000529566 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.67■■■□□ 2.82
TSPAN4-218ENST00000529566 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.52■■■□□ 2.8
TSPAN4-218ENST00000529566 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.09■■■□□ 2.73
TSPAN4-218ENST00000529566 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.99■■■□□ 2.71
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TSPAN4-218ENST00000529566 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.52■■■□□ 2.64
TSPAN4-218ENST00000529566 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.51■■■□□ 2.63
TSPAN4-218ENST00000529566 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.04■■■□□ 2.56
TSPAN4-218ENST00000529566 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.91■■■□□ 2.54
TSPAN4-218ENST00000529566 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.71■■■□□ 2.51
TSPAN4-218ENST00000529566 SMARCA4P51532 1647 aa30.46■■■□□ 2.47
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TSPAN4-218ENST00000529566 NCAPD3P42695 1498 aa30.35■■■□□ 2.45
TSPAN4-218ENST00000529566 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.35■■■□□ 2.45
TSPAN4-218ENST00000529566 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.3■■■□□ 2.44
TSPAN4-218ENST00000529566 SMARCA2P51531 1590 aa30.25■■■□□ 2.43
TSPAN4-218ENST00000529566 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.2■■■□□ 2.42
TSPAN4-218ENST00000529566 HMGXB3Q12766 1538 aa30.14■■■□□ 2.42
TSPAN4-218ENST00000529566 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
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TSPAN4-218ENST00000529566 NESP48681 1621 aa29.6■■■□□ 2.33
TSPAN4-218ENST00000529566 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.47■■■□□ 2.31
TSPAN4-218ENST00000529566 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.45■■■□□ 2.31
TSPAN4-218ENST00000529566 ERCC6Q03468 1493 aa29.41■■■□□ 2.3
TSPAN4-218ENST00000529566 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.31■■■□□ 2.28
TSPAN4-218ENST00000529566 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.29■■■□□ 2.28
TSPAN4-218ENST00000529566 CFTRP13569 1480 aa29.28■■■□□ 2.28
TSPAN4-218ENST00000529566 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.18■■■□□ 2.26
TSPAN4-218ENST00000529566 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
TSPAN4-218ENST00000529566 CUX2O14529 1486 aa29.14■■■□□ 2.26
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TSPAN4-218ENST00000529566 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.08■■■□□ 2.25
TSPAN4-218ENST00000529566 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.01■■■□□ 2.23
TSPAN4-218ENST00000529566 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.99■■■□□ 2.23
TSPAN4-218ENST00000529566 PRDM2Q13029 1718 aa28.93■■■□□ 2.22
TSPAN4-218ENST00000529566 WDR62O43379 1518 aa28.91■■■□□ 2.22
TSPAN4-218ENST00000529566 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
TSPAN4-218ENST00000529566 TOPBP1Q92547 1522 aa28.62■■■□□ 2.17
TSPAN4-218ENST00000529566 ABCC8Q09428 1581 aa28.58■■■□□ 2.17
TSPAN4-218ENST00000529566 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.56■■■□□ 2.16
TSPAN4-218ENST00000529566 IFT140Q96RY7 1462 aa28.43■■■□□ 2.14
TSPAN4-218ENST00000529566 CUX1P39880 1505 aa28.42■■■□□ 2.14
TSPAN4-218ENST00000529566 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
TSPAN4-218ENST00000529566 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
TSPAN4-218ENST00000529566 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.33■■■□□ 2.13
TSPAN4-218ENST00000529566 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
TSPAN4-218ENST00000529566 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.29■■■□□ 2.12
TSPAN4-218ENST00000529566 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.27■■■□□ 2.12
TSPAN4-218ENST00000529566 SOGA1O94964 1423 aa28.26■■■□□ 2.12
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TSPAN4-218ENST00000529566 SYNJ1O43426 1573 aa28.15■■■□□ 2.1
TSPAN4-218ENST00000529566 TOP2BQ02880 1626 aa28.14■■■□□ 2.1
TSPAN4-218ENST00000529566 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
TSPAN4-218ENST00000529566 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.12■■■□□ 2.09
TSPAN4-218ENST00000529566 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.04■■■□□ 2.08
TSPAN4-218ENST00000529566 WDR97A6NE52 1622 aa28.03■■■□□ 2.08
TSPAN4-218ENST00000529566 OSCARQ8IYS5 282 aa27.97■■■□□ 2.07
TSPAN4-218ENST00000529566 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.93■■■□□ 2.06
TSPAN4-218ENST00000529566 GRIN2BQ13224 1484 aa27.92■■■□□ 2.06
TSPAN4-218ENST00000529566 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.9■■■□□ 2.06
TSPAN4-218ENST00000529566 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.88■■■□□ 2.05
TSPAN4-218ENST00000529566 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
TSPAN4-218ENST00000529566 PBRM1Q86U86 1689 aa27.8■■■□□ 2.04
TSPAN4-218ENST00000529566 CHD1O14646 1710 aa27.79■■■□□ 2.04
TSPAN4-218ENST00000529566 FBLN2P98095 1184 aa27.79■■■□□ 2.04
TSPAN4-218ENST00000529566 SYNJ2O15056 1496 aa27.74■■■□□ 2.03
TSPAN4-218ENST00000529566 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
TSPAN4-218ENST00000529566 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.68■■■□□ 2.02
TSPAN4-218ENST00000529566 ADAMTS12P58397 1594 aa27.62■■■□□ 2.01
TSPAN4-218ENST00000529566 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.61■■■□□ 2.01
TSPAN4-218ENST00000529566 KIF27Q86VH2 1401 aa27.61■■■□□ 2.01
TSPAN4-218ENST00000529566 IGF1RP08069 1367 aa27.59■■■□□ 2.01
TSPAN4-218ENST00000529566 GRIN2AQ12879 1464 aa27.56■■■□□ 2
TSPAN4-218ENST00000529566 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.55■■■□□ 2
TSPAN4-218ENST00000529566 TRIM41Q8WV44 630 aa27.53■■■□□ 2
TSPAN4-218ENST00000529566 ARHGEF11O15085 1522 aa27.48■■□□□ 1.99
TSPAN4-218ENST00000529566 NUP160Q12769 1436 aa27.48■■□□□ 1.99
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TSPAN4-218ENST00000529566 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.47■■□□□ 1.99
TSPAN4-218ENST00000529566 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.47■■□□□ 1.99
TSPAN4-218ENST00000529566 CEP170Q5SW79 1584 aa27.43■■□□□ 1.98
TSPAN4-218ENST00000529566 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.42■■□□□ 1.98
TSPAN4-218ENST00000529566 CUL7Q14999 1698 aa27.38■■□□□ 1.97
TSPAN4-218ENST00000529566 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.37■■□□□ 1.97
TSPAN4-218ENST00000529566 ARAP1Q96P48 1450 aa27.29■■□□□ 1.96
TSPAN4-218ENST00000529566 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.27■■□□□ 1.96
TSPAN4-218ENST00000529566 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.26■■□□□ 1.95
TSPAN4-218ENST00000529566 SHROOM2Q13796 1616 aa27.24■■□□□ 1.95
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