Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CPA1P15085 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CPA1P15085 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CPA1P15085 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CPA1P15085 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CPA1P15085 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CPA1P15085 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CPA1P15085 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CPA1P15085 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CPA1P15085 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CPA1P15085 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CPA1P15085 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CPA1P15085 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CPA1P15085 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CPA1P15085 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CPA1P15085 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CPA1P15085 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CPA1P15085 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CPA1P15085 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CPA1P15085 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CPA1P15085 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CPA1P15085 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CPA1P15085 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CPA1P15085 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CPA1P15085 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CPA1P15085 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CPA1P15085 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CPA1P15085 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CPA1P15085 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CPA1P15085 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CPA1P15085 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CPA1P15085 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CPA1P15085 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CPA1P15085 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
CPA1P15085 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CPA1P15085 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CPA1P15085 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CPA1P15085 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CPA1P15085 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CPA1P15085 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CPA1P15085 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CPA1P15085 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CPA1P15085 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CPA1P15085 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CPA1P15085 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CPA1P15085 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CPA1P15085 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CPA1P15085 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CPA1P15085 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CPA1P15085 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CPA1P15085 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CPA1P15085 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CPA1P15085 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CPA1P15085 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CPA1P15085 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CPA1P15085 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CPA1P15085 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CPA1P15085 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CPA1P15085 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CPA1P15085 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CPA1P15085 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CPA1P15085 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CPA1P15085 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CPA1P15085 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CPA1P15085 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CPA1P15085 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CPA1P15085 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CPA1P15085 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CPA1P15085 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CPA1P15085 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CPA1P15085 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CPA1P15085 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CPA1P15085 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CPA1P15085 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CPA1P15085 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CPA1P15085 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CPA1P15085 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CPA1P15085 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CPA1P15085 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CPA1P15085 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CPA1P15085 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CPA1P15085 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CPA1P15085 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CPA1P15085 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CPA1P15085 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CPA1P15085 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CPA1P15085 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CPA1P15085 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CPA1P15085 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CPA1P15085 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CPA1P15085 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CPA1P15085 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CPA1P15085 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CPA1P15085 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CPA1P15085 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CPA1P15085 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CPA1P15085 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CPA1P15085 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CPA1P15085 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CPA1P15085 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms