Protein–RNA interactions for Protein: O95405

ZFYVE9, Zinc finger FYVE domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE9O95405 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ZFYVE9O95405 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ZFYVE9O95405 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ZFYVE9O95405 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ZFYVE9O95405 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ZFYVE9O95405 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ZFYVE9O95405 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ZFYVE9O95405 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ZFYVE9O95405 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ZFYVE9O95405 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ZFYVE9O95405 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ZFYVE9O95405 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ZFYVE9O95405 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ZFYVE9O95405 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ZFYVE9O95405 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ZFYVE9O95405 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ZFYVE9O95405 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ZFYVE9O95405 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ZFYVE9O95405 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
ZFYVE9O95405 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
ZFYVE9O95405 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
ZFYVE9O95405 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
ZFYVE9O95405 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
ZFYVE9O95405 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
ZFYVE9O95405 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ZFYVE9O95405 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ZFYVE9O95405 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ZFYVE9O95405 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ZFYVE9O95405 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ZFYVE9O95405 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ZFYVE9O95405 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ZFYVE9O95405 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ZFYVE9O95405 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ZFYVE9O95405 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ZFYVE9O95405 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ZFYVE9O95405 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
ZFYVE9O95405 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
ZFYVE9O95405 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
ZFYVE9O95405 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
ZFYVE9O95405 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ZFYVE9O95405 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ZFYVE9O95405 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ZFYVE9O95405 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ZFYVE9O95405 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ZFYVE9O95405 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ZFYVE9O95405 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ZFYVE9O95405 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ZFYVE9O95405 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ZFYVE9O95405 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
ZFYVE9O95405 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ZFYVE9O95405 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ZFYVE9O95405 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ZFYVE9O95405 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ZFYVE9O95405 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ZFYVE9O95405 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ZFYVE9O95405 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ZFYVE9O95405 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ZFYVE9O95405 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ZFYVE9O95405 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ZFYVE9O95405 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ZFYVE9O95405 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ZFYVE9O95405 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
ZFYVE9O95405 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
ZFYVE9O95405 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ZFYVE9O95405 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
ZFYVE9O95405 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ZFYVE9O95405 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ZFYVE9O95405 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ZFYVE9O95405 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ZFYVE9O95405 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
ZFYVE9O95405 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ZFYVE9O95405 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ZFYVE9O95405 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ZFYVE9O95405 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
ZFYVE9O95405 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ZFYVE9O95405 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
ZFYVE9O95405 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
ZFYVE9O95405 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ZFYVE9O95405 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ZFYVE9O95405 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ZFYVE9O95405 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ZFYVE9O95405 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
ZFYVE9O95405 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC33.81■■■■□ 3
ZFYVE9O95405 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ZFYVE9O95405 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
ZFYVE9O95405 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
ZFYVE9O95405 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
ZFYVE9O95405 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ZFYVE9O95405 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
ZFYVE9O95405 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
ZFYVE9O95405 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ZFYVE9O95405 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
ZFYVE9O95405 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ZFYVE9O95405 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ZFYVE9O95405 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC33.78■■■■□ 3
ZFYVE9O95405 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC33.78■■■■□ 3
ZFYVE9O95405 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
ZFYVE9O95405 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
ZFYVE9O95405 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ZFYVE9O95405 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms