Protein–RNA interactions for Protein: O43313

ATMIN, ATM interactor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMINO43313 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATMINO43313 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATMINO43313 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATMINO43313 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATMINO43313 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATMINO43313 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATMINO43313 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATMINO43313 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATMINO43313 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATMINO43313 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATMINO43313 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATMINO43313 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATMINO43313 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATMINO43313 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATMINO43313 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATMINO43313 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATMINO43313 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATMINO43313 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATMINO43313 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATMINO43313 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATMINO43313 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATMINO43313 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATMINO43313 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATMINO43313 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATMINO43313 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATMINO43313 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATMINO43313 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATMINO43313 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATMINO43313 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATMINO43313 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATMINO43313 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATMINO43313 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATMINO43313 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATMINO43313 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATMINO43313 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATMINO43313 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATMINO43313 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ATMINO43313 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATMINO43313 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATMINO43313 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATMINO43313 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATMINO43313 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATMINO43313 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATMINO43313 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATMINO43313 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATMINO43313 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ATMINO43313 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ATMINO43313 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATMINO43313 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATMINO43313 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATMINO43313 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATMINO43313 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATMINO43313 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATMINO43313 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATMINO43313 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATMINO43313 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATMINO43313 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATMINO43313 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATMINO43313 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATMINO43313 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATMINO43313 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATMINO43313 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATMINO43313 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ATMINO43313 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATMINO43313 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ATMINO43313 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATMINO43313 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATMINO43313 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATMINO43313 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATMINO43313 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATMINO43313 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATMINO43313 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATMINO43313 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATMINO43313 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATMINO43313 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATMINO43313 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ATMINO43313 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATMINO43313 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATMINO43313 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATMINO43313 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ATMINO43313 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATMINO43313 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATMINO43313 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATMINO43313 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATMINO43313 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATMINO43313 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATMINO43313 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATMINO43313 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATMINO43313 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATMINO43313 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATMINO43313 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ATMINO43313 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATMINO43313 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATMINO43313 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATMINO43313 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATMINO43313 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATMINO43313 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATMINO43313 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATMINO43313 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATMINO43313 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms