Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CROTQ9UKG9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CROTQ9UKG9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CROTQ9UKG9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CROTQ9UKG9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CROTQ9UKG9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CROTQ9UKG9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CROTQ9UKG9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CROTQ9UKG9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CROTQ9UKG9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CROTQ9UKG9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CROTQ9UKG9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CROTQ9UKG9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CROTQ9UKG9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CROTQ9UKG9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CROTQ9UKG9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CROTQ9UKG9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CROTQ9UKG9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CROTQ9UKG9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CROTQ9UKG9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CROTQ9UKG9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CROTQ9UKG9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CROTQ9UKG9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CROTQ9UKG9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CROTQ9UKG9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CROTQ9UKG9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CROTQ9UKG9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CROTQ9UKG9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CROTQ9UKG9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CROTQ9UKG9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CROTQ9UKG9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CROTQ9UKG9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CROTQ9UKG9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CROTQ9UKG9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CROTQ9UKG9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CROTQ9UKG9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CROTQ9UKG9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CROTQ9UKG9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CROTQ9UKG9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CROTQ9UKG9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CROTQ9UKG9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CROTQ9UKG9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CROTQ9UKG9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CROTQ9UKG9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CROTQ9UKG9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CROTQ9UKG9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CROTQ9UKG9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CROTQ9UKG9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CROTQ9UKG9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CROTQ9UKG9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CROTQ9UKG9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CROTQ9UKG9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CROTQ9UKG9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CROTQ9UKG9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CROTQ9UKG9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CROTQ9UKG9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CROTQ9UKG9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CROTQ9UKG9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CROTQ9UKG9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CROTQ9UKG9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CROTQ9UKG9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CROTQ9UKG9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CROTQ9UKG9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CROTQ9UKG9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CROTQ9UKG9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CROTQ9UKG9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CROTQ9UKG9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CROTQ9UKG9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CROTQ9UKG9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CROTQ9UKG9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CROTQ9UKG9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CROTQ9UKG9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CROTQ9UKG9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CROTQ9UKG9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CROTQ9UKG9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CROTQ9UKG9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CROTQ9UKG9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CROTQ9UKG9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CROTQ9UKG9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CROTQ9UKG9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CROTQ9UKG9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CROTQ9UKG9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CROTQ9UKG9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CROTQ9UKG9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CROTQ9UKG9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CROTQ9UKG9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CROTQ9UKG9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CROTQ9UKG9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CROTQ9UKG9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CROTQ9UKG9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CROTQ9UKG9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CROTQ9UKG9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CROTQ9UKG9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CROTQ9UKG9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CROTQ9UKG9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CROTQ9UKG9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CROTQ9UKG9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CROTQ9UKG9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CROTQ9UKG9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CROTQ9UKG9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms