Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
HOXC10Q9NYD6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
HOXC10Q9NYD6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
HOXC10Q9NYD6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
HOXC10Q9NYD6 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
HOXC10Q9NYD6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
HOXC10Q9NYD6 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
HOXC10Q9NYD6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
HOXC10Q9NYD6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
HOXC10Q9NYD6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
HOXC10Q9NYD6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
HOXC10Q9NYD6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
HOXC10Q9NYD6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
HOXC10Q9NYD6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
HOXC10Q9NYD6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
HOXC10Q9NYD6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
HOXC10Q9NYD6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
HOXC10Q9NYD6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
HOXC10Q9NYD6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
HOXC10Q9NYD6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
HOXC10Q9NYD6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
HOXC10Q9NYD6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
HOXC10Q9NYD6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
HOXC10Q9NYD6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
HOXC10Q9NYD6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
HOXC10Q9NYD6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
HOXC10Q9NYD6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
HOXC10Q9NYD6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
HOXC10Q9NYD6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
HOXC10Q9NYD6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
HOXC10Q9NYD6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
HOXC10Q9NYD6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
HOXC10Q9NYD6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
HOXC10Q9NYD6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
HOXC10Q9NYD6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
HOXC10Q9NYD6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
HOXC10Q9NYD6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
HOXC10Q9NYD6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
HOXC10Q9NYD6 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
HOXC10Q9NYD6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
HOXC10Q9NYD6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
HOXC10Q9NYD6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
HOXC10Q9NYD6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
HOXC10Q9NYD6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC33.2■■■□□ 2.91
HOXC10Q9NYD6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
HOXC10Q9NYD6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
HOXC10Q9NYD6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
HOXC10Q9NYD6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
HOXC10Q9NYD6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
HOXC10Q9NYD6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
HOXC10Q9NYD6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
HOXC10Q9NYD6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
HOXC10Q9NYD6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
HOXC10Q9NYD6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
HOXC10Q9NYD6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
HOXC10Q9NYD6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
HOXC10Q9NYD6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
HOXC10Q9NYD6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
HOXC10Q9NYD6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
HOXC10Q9NYD6 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
HOXC10Q9NYD6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
HOXC10Q9NYD6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
HOXC10Q9NYD6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
HOXC10Q9NYD6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
HOXC10Q9NYD6 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
HOXC10Q9NYD6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
HOXC10Q9NYD6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
HOXC10Q9NYD6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
HOXC10Q9NYD6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
HOXC10Q9NYD6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
HOXC10Q9NYD6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
HOXC10Q9NYD6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
HOXC10Q9NYD6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
HOXC10Q9NYD6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
HOXC10Q9NYD6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
HOXC10Q9NYD6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
HOXC10Q9NYD6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
HOXC10Q9NYD6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
HOXC10Q9NYD6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
HOXC10Q9NYD6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
HOXC10Q9NYD6 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
HOXC10Q9NYD6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
HOXC10Q9NYD6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
HOXC10Q9NYD6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
HOXC10Q9NYD6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
HOXC10Q9NYD6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
HOXC10Q9NYD6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
HOXC10Q9NYD6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
HOXC10Q9NYD6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
HOXC10Q9NYD6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
HOXC10Q9NYD6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
HOXC10Q9NYD6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
HOXC10Q9NYD6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
HOXC10Q9NYD6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
HOXC10Q9NYD6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
HOXC10Q9NYD6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
HOXC10Q9NYD6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
HOXC10Q9NYD6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
HOXC10Q9NYD6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
HOXC10Q9NYD6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms