Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB1

RBFOX1, RNA binding protein fox-1 homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX1Q9NWB1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBFOX1Q9NWB1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBFOX1Q9NWB1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBFOX1Q9NWB1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBFOX1Q9NWB1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBFOX1Q9NWB1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBFOX1Q9NWB1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBFOX1Q9NWB1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBFOX1Q9NWB1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBFOX1Q9NWB1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBFOX1Q9NWB1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBFOX1Q9NWB1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBFOX1Q9NWB1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBFOX1Q9NWB1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBFOX1Q9NWB1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBFOX1Q9NWB1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBFOX1Q9NWB1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBFOX1Q9NWB1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBFOX1Q9NWB1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBFOX1Q9NWB1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBFOX1Q9NWB1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBFOX1Q9NWB1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RBFOX1Q9NWB1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RBFOX1Q9NWB1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RBFOX1Q9NWB1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBFOX1Q9NWB1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBFOX1Q9NWB1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBFOX1Q9NWB1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBFOX1Q9NWB1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBFOX1Q9NWB1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBFOX1Q9NWB1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBFOX1Q9NWB1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBFOX1Q9NWB1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBFOX1Q9NWB1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBFOX1Q9NWB1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBFOX1Q9NWB1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RBFOX1Q9NWB1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBFOX1Q9NWB1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBFOX1Q9NWB1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBFOX1Q9NWB1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBFOX1Q9NWB1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RBFOX1Q9NWB1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBFOX1Q9NWB1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBFOX1Q9NWB1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBFOX1Q9NWB1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBFOX1Q9NWB1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBFOX1Q9NWB1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RBFOX1Q9NWB1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBFOX1Q9NWB1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBFOX1Q9NWB1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBFOX1Q9NWB1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBFOX1Q9NWB1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RBFOX1Q9NWB1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBFOX1Q9NWB1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBFOX1Q9NWB1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBFOX1Q9NWB1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBFOX1Q9NWB1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBFOX1Q9NWB1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBFOX1Q9NWB1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RBFOX1Q9NWB1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBFOX1Q9NWB1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBFOX1Q9NWB1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBFOX1Q9NWB1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBFOX1Q9NWB1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBFOX1Q9NWB1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBFOX1Q9NWB1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RBFOX1Q9NWB1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBFOX1Q9NWB1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBFOX1Q9NWB1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
RBFOX1Q9NWB1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBFOX1Q9NWB1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBFOX1Q9NWB1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBFOX1Q9NWB1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBFOX1Q9NWB1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RBFOX1Q9NWB1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBFOX1Q9NWB1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBFOX1Q9NWB1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBFOX1Q9NWB1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RBFOX1Q9NWB1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RBFOX1Q9NWB1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RBFOX1Q9NWB1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RBFOX1Q9NWB1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBFOX1Q9NWB1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBFOX1Q9NWB1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBFOX1Q9NWB1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBFOX1Q9NWB1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBFOX1Q9NWB1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBFOX1Q9NWB1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBFOX1Q9NWB1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBFOX1Q9NWB1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBFOX1Q9NWB1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBFOX1Q9NWB1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBFOX1Q9NWB1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBFOX1Q9NWB1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBFOX1Q9NWB1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBFOX1Q9NWB1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBFOX1Q9NWB1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBFOX1Q9NWB1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBFOX1Q9NWB1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBFOX1Q9NWB1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms