Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EFHD1Q9BUP0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EFHD1Q9BUP0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EFHD1Q9BUP0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EFHD1Q9BUP0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EFHD1Q9BUP0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EFHD1Q9BUP0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EFHD1Q9BUP0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EFHD1Q9BUP0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EFHD1Q9BUP0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EFHD1Q9BUP0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EFHD1Q9BUP0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EFHD1Q9BUP0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EFHD1Q9BUP0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EFHD1Q9BUP0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EFHD1Q9BUP0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EFHD1Q9BUP0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EFHD1Q9BUP0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EFHD1Q9BUP0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EFHD1Q9BUP0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
EFHD1Q9BUP0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
EFHD1Q9BUP0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EFHD1Q9BUP0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
EFHD1Q9BUP0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EFHD1Q9BUP0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EFHD1Q9BUP0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EFHD1Q9BUP0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EFHD1Q9BUP0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EFHD1Q9BUP0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
EFHD1Q9BUP0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EFHD1Q9BUP0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EFHD1Q9BUP0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EFHD1Q9BUP0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EFHD1Q9BUP0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EFHD1Q9BUP0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EFHD1Q9BUP0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EFHD1Q9BUP0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EFHD1Q9BUP0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EFHD1Q9BUP0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EFHD1Q9BUP0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EFHD1Q9BUP0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EFHD1Q9BUP0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
EFHD1Q9BUP0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EFHD1Q9BUP0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EFHD1Q9BUP0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EFHD1Q9BUP0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EFHD1Q9BUP0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
EFHD1Q9BUP0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EFHD1Q9BUP0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EFHD1Q9BUP0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EFHD1Q9BUP0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EFHD1Q9BUP0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EFHD1Q9BUP0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
EFHD1Q9BUP0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EFHD1Q9BUP0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EFHD1Q9BUP0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EFHD1Q9BUP0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EFHD1Q9BUP0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EFHD1Q9BUP0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EFHD1Q9BUP0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EFHD1Q9BUP0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.57■■■□□ 2
EFHD1Q9BUP0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EFHD1Q9BUP0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EFHD1Q9BUP0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EFHD1Q9BUP0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
EFHD1Q9BUP0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
EFHD1Q9BUP0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EFHD1Q9BUP0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EFHD1Q9BUP0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EFHD1Q9BUP0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EFHD1Q9BUP0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EFHD1Q9BUP0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EFHD1Q9BUP0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
EFHD1Q9BUP0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EFHD1Q9BUP0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EFHD1Q9BUP0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EFHD1Q9BUP0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EFHD1Q9BUP0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EFHD1Q9BUP0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EFHD1Q9BUP0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EFHD1Q9BUP0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EFHD1Q9BUP0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EFHD1Q9BUP0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EFHD1Q9BUP0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EFHD1Q9BUP0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EFHD1Q9BUP0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EFHD1Q9BUP0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
EFHD1Q9BUP0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EFHD1Q9BUP0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EFHD1Q9BUP0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EFHD1Q9BUP0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EFHD1Q9BUP0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EFHD1Q9BUP0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EFHD1Q9BUP0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EFHD1Q9BUP0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EFHD1Q9BUP0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EFHD1Q9BUP0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EFHD1Q9BUP0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EFHD1Q9BUP0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EFHD1Q9BUP0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms