Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RTKNQ9BST9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RTKNQ9BST9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RTKNQ9BST9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
RTKNQ9BST9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RTKNQ9BST9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RTKNQ9BST9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RTKNQ9BST9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RTKNQ9BST9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RTKNQ9BST9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RTKNQ9BST9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RTKNQ9BST9 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RTKNQ9BST9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RTKNQ9BST9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RTKNQ9BST9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RTKNQ9BST9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RTKNQ9BST9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RTKNQ9BST9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RTKNQ9BST9 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RTKNQ9BST9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RTKNQ9BST9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RTKNQ9BST9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
RTKNQ9BST9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RTKNQ9BST9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RTKNQ9BST9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RTKNQ9BST9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
RTKNQ9BST9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RTKNQ9BST9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RTKNQ9BST9 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RTKNQ9BST9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RTKNQ9BST9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
RTKNQ9BST9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RTKNQ9BST9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RTKNQ9BST9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RTKNQ9BST9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RTKNQ9BST9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RTKNQ9BST9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
RTKNQ9BST9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RTKNQ9BST9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RTKNQ9BST9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RTKNQ9BST9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RTKNQ9BST9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
RTKNQ9BST9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RTKNQ9BST9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
RTKNQ9BST9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RTKNQ9BST9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RTKNQ9BST9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RTKNQ9BST9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RTKNQ9BST9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RTKNQ9BST9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RTKNQ9BST9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RTKNQ9BST9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RTKNQ9BST9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RTKNQ9BST9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RTKNQ9BST9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RTKNQ9BST9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RTKNQ9BST9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RTKNQ9BST9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RTKNQ9BST9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RTKNQ9BST9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RTKNQ9BST9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RTKNQ9BST9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RTKNQ9BST9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RTKNQ9BST9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RTKNQ9BST9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RTKNQ9BST9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RTKNQ9BST9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RTKNQ9BST9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RTKNQ9BST9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RTKNQ9BST9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RTKNQ9BST9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RTKNQ9BST9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
RTKNQ9BST9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RTKNQ9BST9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RTKNQ9BST9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RTKNQ9BST9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RTKNQ9BST9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RTKNQ9BST9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RTKNQ9BST9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RTKNQ9BST9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RTKNQ9BST9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RTKNQ9BST9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RTKNQ9BST9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RTKNQ9BST9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RTKNQ9BST9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RTKNQ9BST9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RTKNQ9BST9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RTKNQ9BST9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RTKNQ9BST9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RTKNQ9BST9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RTKNQ9BST9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
RTKNQ9BST9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RTKNQ9BST9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RTKNQ9BST9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RTKNQ9BST9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
RTKNQ9BST9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RTKNQ9BST9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RTKNQ9BST9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RTKNQ9BST9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
RTKNQ9BST9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms