Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRD0

BUD13, BUD13 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 619 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD13Q9BRD0 CPNE1-212ENST00000430570 1332 ntTSL 527.98■■■□□ 2.074e-13■■■■■ 56.2
BUD13Q9BRD0 CPNE1-216ENST00000437340 1755 ntTSL 1 (best)27.59■■■□□ 2.014e-13■■■■■ 56.2
BUD13Q9BRD0 CPNE1-205ENST00000401607 1795 ntTSL 527.17■■□□□ 1.944e-13■■■■■ 56.2
BUD13Q9BRD0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.884e-13■■■■■ 56.2
BUD13Q9BRD0 CPNE1-204ENST00000397443 1928 ntAPPRIS P1 TSL 522.61■■□□□ 1.214e-13■■■■■ 56.2
BUD13Q9BRD0 CPNE1-224ENST00000483359 1975 ntTSL 519.66■□□□□ 0.744e-13■■■■■ 56.2
BUD13Q9BRD0 CPNE1-201ENST00000317677 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.214e-13■■■■■ 56.2
BUD13Q9BRD0 CKB-212ENST00000555366 419 ntTSL 214.57□□□□□ -0.085e-11■■■■■ 55.8
BUD13Q9BRD0 LAT-208ENST00000563964 710 ntTSL 527.19■■□□□ 1.942e-11■■■■■ 55.3
BUD13Q9BRD0 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.392e-11■■■■■ 55.3
BUD13Q9BRD0 RIT1-203ENST00000461050 803 ntTSL 515.38■□□□□ 0.052e-11■■■■■ 55.3
BUD13Q9BRD0 RIT1-204ENST00000462687 548 ntTSL 312.1□□□□□ -0.472e-11■■■■■ 55.3
BUD13Q9BRD0 RIT1-202ENST00000368323 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.582e-11■■■■■ 55.3
BUD13Q9BRD0 RIT1-201ENST00000368322 855 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.792e-11■■■■■ 55.3
BUD13Q9BRD0 RIT1-206ENST00000609492 574 ntTSL 1 (best)9.55□□□□□ -0.882e-11■■■■■ 55.3
BUD13Q9BRD0 MALRD1-205ENST00000480707 414 ntTSL 36.7□□□□□ -1.342e-11■■■■■ 55.3
BUD13Q9BRD0 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC7.67□□□□□ -1.182e-35■■■■■ 55.2
BUD13Q9BRD0 CTSB-223ENST00000532370 693 ntTSL 219.8■□□□□ 0.769e-8■■■■■ 55.1
BUD13Q9BRD0 CTSB-229ENST00000533572 975 ntTSL 319.42■□□□□ 0.79e-8■■■■■ 55.1
BUD13Q9BRD0 CTSB-215ENST00000528965 556 ntTSL 318.39■□□□□ 0.539e-8■■■■■ 55.1
BUD13Q9BRD0 CTSB-214ENST00000527243 580 ntTSL 412.7□□□□□ -0.389e-8■■■■■ 55.1
BUD13Q9BRD0 CTSB-207ENST00000524654 368 ntTSL 512.61□□□□□ -0.399e-8■■■■■ 55.1
BUD13Q9BRD0 SETDB1-212ENST00000497314 2321 ntTSL 211.57□□□□□ -0.561e-8■■■■■ 55
BUD13Q9BRD0 SETDB1-216ENST00000533529 485 ntTSL 37.74□□□□□ -1.171e-8■■■■■ 55
BUD13Q9BRD0 EEF1B2-210ENST00000479587 701 ntTSL 217.32■□□□□ 0.364e-12■■■■■ 54.2
BUD13Q9BRD0 EEF1B2-209ENST00000460760 1025 ntTSL 213.02□□□□□ -0.334e-12■■■■■ 54.2
BUD13Q9BRD0 PABPC4-214ENST00000483770 476 ntTSL 210.65□□□□□ -0.74e-18■■■■■ 54
BUD13Q9BRD0 PABPC4-220ENST00000525669 582 ntTSL 29.18□□□□□ -0.944e-18■■■■■ 54
BUD13Q9BRD0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.836e-11■■■■■ 52.8
BUD13Q9BRD0 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.266e-11■■■■■ 52.8
BUD13Q9BRD0 NBPF9-201ENST00000483630 1915 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.676e-11■■■■■ 52.8
BUD13Q9BRD0 NBPF9-202ENST00000584027 5034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.846e-11■■■■■ 52.8
BUD13Q9BRD0 RNA5-8SP2-201ENST00000363564 152 ntBASIC9.76□□□□□ -0.856e-11■■■■■ 52.8
BUD13Q9BRD0 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.216e-11■■■■■ 52.8
BUD13Q9BRD0 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.246e-11■■■■■ 52.8
BUD13Q9BRD0 NBPF9-204ENST00000611593 3509 ntTSL 27.2□□□□□ -1.266e-11■■■■■ 52.8
BUD13Q9BRD0 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.286e-11■■■■■ 52.8
BUD13Q9BRD0 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.566e-11■■■■■ 52.8
BUD13Q9BRD0 FN1-219ENST00000474036 1058 ntTSL 26.55□□□□□ -1.361e-323■■■■■ 52.1
BUD13Q9BRD0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.141e-8■■■■■ 51.9
BUD13Q9BRD0 LDLRAP1-203ENST00000470950 995 ntTSL 316.36■□□□□ 0.211e-14■■■■■ 51.9
BUD13Q9BRD0 SLC6A8-202ENST00000413787 468 ntTSL 520.62■□□□□ 0.894e-19■■■■■ 51.8
BUD13Q9BRD0 TNS1-216ENST00000480665 758 ntTSL 217.83■□□□□ 0.447e-10■■■■■ 51.3
BUD13Q9BRD0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.891e-7■■■■■ 51.2
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BUD13Q9BRD0 SMUG1-217ENST00000509864 621 ntTSL 316.12■□□□□ 0.171e-7■■■■■ 51.2
BUD13Q9BRD0 SMUG1-213ENST00000506595 712 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.111e-7■■■■■ 51.2
BUD13Q9BRD0 SMUG1-216ENST00000509078 598 ntTSL 412.21□□□□□ -0.451e-7■■■■■ 51.2
BUD13Q9BRD0 PKM-211ENST00000564276 753 ntTSL 1 (best)11.19□□□□□ -0.624e-10■■■■■ 50.7
BUD13Q9BRD0 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.124e-10■■■■■ 50.6
BUD13Q9BRD0 LDHA-215ENST00000537296 1511 ntTSL 212.36□□□□□ -0.434e-10■■■■■ 50.6
BUD13Q9BRD0 LDHA-216ENST00000538451 1345 ntTSL 210.71□□□□□ -0.694e-10■■■■■ 50.6
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BUD13Q9BRD0 LDHA-220ENST00000542179 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.864e-10■■■■■ 50.6
BUD13Q9BRD0 LDHA-210ENST00000486690 664 ntTSL 58.67□□□□□ -1.024e-10■■■■■ 50.6
BUD13Q9BRD0 LDHA-202ENST00000375710 2169 ntTSL 27.62□□□□□ -1.194e-10■■■■■ 50.6
BUD13Q9BRD0 CIPC-208ENST00000557115 882 ntTSL 425.28■■□□□ 1.642e-10■■■■■ 50.3
BUD13Q9BRD0 THOC6-210ENST00000576143 960 ntTSL 325.27■■□□□ 1.643e-10■■■■■ 50.3
BUD13Q9BRD0 THOC6-205ENST00000573704 991 ntTSL 525.27■■□□□ 1.643e-10■■■■■ 50.3
BUD13Q9BRD0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.242e-10■■■■■ 50.3
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BUD13Q9BRD0 SLC51A-206ENST00000471430 449 ntTSL 521.43■■□□□ 1.022e-10■■■■■ 50.3
BUD13Q9BRD0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.861e-6■■■■■ 50.3
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BUD13Q9BRD0 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.751e-6■■■■■ 50.3
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BUD13Q9BRD0 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.132e-10■■■■■ 50.3
BUD13Q9BRD0 PLEKHA7-204ENST00000525177 673 ntTSL 215.76■□□□□ 0.112e-10■■■■■ 50.3
BUD13Q9BRD0 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.082e-10■■■■■ 50.3
BUD13Q9BRD0 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.072e-10■■■■■ 50.3
BUD13Q9BRD0 BZW2-209ENST00000437745 1711 ntTSL 1 (best)15.11■□□□□ 0.012e-10■■■■■ 50.3
BUD13Q9BRD0 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.082e-10■■■■■ 50.3
BUD13Q9BRD0 CIPC-202ENST00000554447 596 ntTSL 413.78□□□□□ -0.22e-10■■■■■ 50.3
BUD13Q9BRD0 TACC2-213ENST00000465600 3109 ntTSL 212.7□□□□□ -0.382e-10■■■■■ 50.3
BUD13Q9BRD0 CIPC-206ENST00000555611 599 ntTSL 4 BASIC12.18□□□□□ -0.462e-10■■■■■ 50.3
BUD13Q9BRD0 BZW2-214ENST00000630952 1721 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.472e-10■■■■■ 50.3
BUD13Q9BRD0 BZW2-203ENST00000407633 898 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.682e-10■■■■■ 50.3
BUD13Q9BRD0 CIPC-204ENST00000555200 581 ntTSL 310.62□□□□□ -0.712e-10■■■■■ 50.3
BUD13Q9BRD0 BZW2-207ENST00000433922 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.762e-10■■■■■ 50.3
BUD13Q9BRD0 BZW2-212ENST00000452975 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.782e-10■■■■■ 50.3
BUD13Q9BRD0 BZW2-202ENST00000405202 1689 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.782e-10■■■■■ 50.3
BUD13Q9BRD0 AC007375.2-201ENST00000557752 603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.792e-10■■■■■ 50.3
BUD13Q9BRD0 BZW2-201ENST00000258761 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.82e-10■■■■■ 50.3
BUD13Q9BRD0 BZW2-208ENST00000436868 1784 ntTSL 59.17□□□□□ -0.942e-10■■■■■ 50.3
BUD13Q9BRD0 TMEM123-207ENST00000531103 568 ntTSL 46.06□□□□□ -1.442e-10■■■■■ 50.3
BUD13Q9BRD0 KDM5B-204ENST00000456180 558 ntTSL 45.94□□□□□ -1.462e-10■■■■■ 50.3
BUD13Q9BRD0 TMEM123-205ENST00000528969 568 ntAPPRIS ALT2 TSL 45.19□□□□□ -1.582e-10■■■■■ 50.3
BUD13Q9BRD0 NISCH-211ENST00000488243 584 ntTSL 212.92□□□□□ -0.348e-14■■■■■ 49.3
BUD13Q9BRD0 RELT-204ENST00000539134 3244 ntTSL 213.78□□□□□ -0.21e-7■■■■■ 48.7
BUD13Q9BRD0 RELT-203ENST00000537771 768 ntTSL 312.42□□□□□ -0.421e-7■■■■■ 48.7
BUD13Q9BRD0 LPCAT4-205ENST00000563748 1357 ntTSL 218.4■□□□□ 0.541e-16■■■■■ 48.7
BUD13Q9BRD0 LPCAT4-207ENST00000567507 672 ntTSL 39.54□□□□□ -0.881e-16■■■■■ 48.7
BUD13Q9BRD0 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC8.04□□□□□ -1.123e-28■■■■■ 48.6
BUD13Q9BRD0 HBE1-201ENST00000292896 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.711e-12■■■■■ 48
BUD13Q9BRD0 HBE1-202ENST00000380237 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.761e-12■■■■■ 48
BUD13Q9BRD0 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC15.53■□□□□ 0.081e-23■■■■■ 47.8
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