Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRD0

BUD13, BUD13 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD13Q9BRD0 CPNE1-212ENST00000430570 1332 ntTSL 527.98■■■□□ 2.074e-13■■■■■ 56.2
BUD13Q9BRD0 CPNE1-216ENST00000437340 1755 ntTSL 1 (best)27.59■■■□□ 2.014e-13■■■■■ 56.2
BUD13Q9BRD0 CPNE1-205ENST00000401607 1795 ntTSL 527.17■■□□□ 1.944e-13■■■■■ 56.2
BUD13Q9BRD0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.884e-13■■■■■ 56.2
BUD13Q9BRD0 CPNE1-204ENST00000397443 1928 ntAPPRIS P1 TSL 522.61■■□□□ 1.214e-13■■■■■ 56.2
BUD13Q9BRD0 CPNE1-224ENST00000483359 1975 ntTSL 519.66■□□□□ 0.744e-13■■■■■ 56.2
BUD13Q9BRD0 CPNE1-201ENST00000317677 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.214e-13■■■■■ 56.2
BUD13Q9BRD0 CKB-212ENST00000555366 419 ntTSL 214.57□□□□□ -0.085e-11■■■■■ 55.8
BUD13Q9BRD0 LAT-208ENST00000563964 710 ntTSL 527.19■■□□□ 1.942e-11■■■■■ 55.3
BUD13Q9BRD0 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.392e-11■■■■■ 55.3
BUD13Q9BRD0 RIT1-203ENST00000461050 803 ntTSL 515.38■□□□□ 0.052e-11■■■■■ 55.3
BUD13Q9BRD0 RIT1-204ENST00000462687 548 ntTSL 312.1□□□□□ -0.472e-11■■■■■ 55.3
BUD13Q9BRD0 RIT1-202ENST00000368323 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.582e-11■■■■■ 55.3
BUD13Q9BRD0 RIT1-201ENST00000368322 855 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.792e-11■■■■■ 55.3
BUD13Q9BRD0 RIT1-206ENST00000609492 574 ntTSL 1 (best)9.55□□□□□ -0.882e-11■■■■■ 55.3
BUD13Q9BRD0 MALRD1-205ENST00000480707 414 ntTSL 36.7□□□□□ -1.342e-11■■■■■ 55.3
BUD13Q9BRD0 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC7.67□□□□□ -1.182e-35■■■■■ 55.2
BUD13Q9BRD0 CTSB-223ENST00000532370 693 ntTSL 219.8■□□□□ 0.769e-8■■■■■ 55.1
BUD13Q9BRD0 CTSB-229ENST00000533572 975 ntTSL 319.42■□□□□ 0.79e-8■■■■■ 55.1
BUD13Q9BRD0 CTSB-215ENST00000528965 556 ntTSL 318.39■□□□□ 0.539e-8■■■■■ 55.1
BUD13Q9BRD0 CTSB-214ENST00000527243 580 ntTSL 412.7□□□□□ -0.389e-8■■■■■ 55.1
BUD13Q9BRD0 CTSB-207ENST00000524654 368 ntTSL 512.61□□□□□ -0.399e-8■■■■■ 55.1
BUD13Q9BRD0 SETDB1-212ENST00000497314 2321 ntTSL 211.57□□□□□ -0.561e-8■■■■■ 55
BUD13Q9BRD0 SETDB1-216ENST00000533529 485 ntTSL 37.74□□□□□ -1.171e-8■■■■■ 55
BUD13Q9BRD0 EEF1B2-210ENST00000479587 701 ntTSL 217.32■□□□□ 0.364e-12■■■■■ 54.2
BUD13Q9BRD0 EEF1B2-209ENST00000460760 1025 ntTSL 213.02□□□□□ -0.334e-12■■■■■ 54.2
BUD13Q9BRD0 PABPC4-214ENST00000483770 476 ntTSL 210.65□□□□□ -0.74e-18■■■■■ 54
BUD13Q9BRD0 PABPC4-220ENST00000525669 582 ntTSL 29.18□□□□□ -0.944e-18■■■■■ 54
BUD13Q9BRD0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.836e-11■■■■■ 52.8
BUD13Q9BRD0 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.266e-11■■■■■ 52.8
BUD13Q9BRD0 NBPF9-201ENST00000483630 1915 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.676e-11■■■■■ 52.8
BUD13Q9BRD0 NBPF9-202ENST00000584027 5034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.846e-11■■■■■ 52.8
BUD13Q9BRD0 RNA5-8SP2-201ENST00000363564 152 ntBASIC9.76□□□□□ -0.856e-11■■■■■ 52.8
BUD13Q9BRD0 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.216e-11■■■■■ 52.8
BUD13Q9BRD0 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.246e-11■■■■■ 52.8
BUD13Q9BRD0 NBPF9-204ENST00000611593 3509 ntTSL 27.2□□□□□ -1.266e-11■■■■■ 52.8
BUD13Q9BRD0 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.286e-11■■■■■ 52.8
BUD13Q9BRD0 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.566e-11■■■■■ 52.8
BUD13Q9BRD0 FN1-219ENST00000474036 1058 ntTSL 26.55□□□□□ -1.361e-323■■■■■ 52.1
BUD13Q9BRD0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.141e-8■■■■■ 51.9
BUD13Q9BRD0 LDLRAP1-203ENST00000470950 995 ntTSL 316.36■□□□□ 0.211e-14■■■■■ 51.9
BUD13Q9BRD0 SLC6A8-202ENST00000413787 468 ntTSL 520.62■□□□□ 0.894e-19■■■■■ 51.8
BUD13Q9BRD0 TNS1-216ENST00000480665 758 ntTSL 217.83■□□□□ 0.447e-10■■■■■ 51.3
BUD13Q9BRD0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.891e-7■■■■■ 51.2
BUD13Q9BRD0 SMUG1-211ENST00000505662 1422 ntTSL 324■■□□□ 1.431e-7■■■■■ 51.2
BUD13Q9BRD0 SMUG1-217ENST00000509864 621 ntTSL 316.12■□□□□ 0.171e-7■■■■■ 51.2
BUD13Q9BRD0 SMUG1-213ENST00000506595 712 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.111e-7■■■■■ 51.2
BUD13Q9BRD0 SMUG1-216ENST00000509078 598 ntTSL 412.21□□□□□ -0.451e-7■■■■■ 51.2
BUD13Q9BRD0 PKM-211ENST00000564276 753 ntTSL 1 (best)11.19□□□□□ -0.624e-10■■■■■ 50.7
BUD13Q9BRD0 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.124e-10■■■■■ 50.6
BUD13Q9BRD0 LDHA-215ENST00000537296 1511 ntTSL 212.36□□□□□ -0.434e-10■■■■■ 50.6
BUD13Q9BRD0 LDHA-216ENST00000538451 1345 ntTSL 210.71□□□□□ -0.694e-10■■■■■ 50.6
BUD13Q9BRD0 LDHA-218ENST00000540430 2305 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.794e-10■■■■■ 50.6
BUD13Q9BRD0 LDHA-220ENST00000542179 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.864e-10■■■■■ 50.6
BUD13Q9BRD0 LDHA-210ENST00000486690 664 ntTSL 58.67□□□□□ -1.024e-10■■■■■ 50.6
BUD13Q9BRD0 LDHA-202ENST00000375710 2169 ntTSL 27.62□□□□□ -1.194e-10■■■■■ 50.6
BUD13Q9BRD0 CIPC-208ENST00000557115 882 ntTSL 425.28■■□□□ 1.642e-10■■■■■ 50.3
BUD13Q9BRD0 THOC6-210ENST00000576143 960 ntTSL 325.27■■□□□ 1.643e-10■■■■■ 50.3
BUD13Q9BRD0 THOC6-205ENST00000573704 991 ntTSL 525.27■■□□□ 1.643e-10■■■■■ 50.3
BUD13Q9BRD0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.242e-10■■■■■ 50.3
BUD13Q9BRD0 MAFF-205ENST00000441709 548 ntTSL 222.56■■□□□ 1.21e-6■■■■■ 50.3
BUD13Q9BRD0 SLC51A-206ENST00000471430 449 ntTSL 521.43■■□□□ 1.022e-10■■■■■ 50.3
BUD13Q9BRD0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.861e-6■■■■■ 50.3
BUD13Q9BRD0 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.791e-6■■■■■ 50.3
BUD13Q9BRD0 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.751e-6■■■■■ 50.3
BUD13Q9BRD0 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.672e-10■■■■■ 50.3
BUD13Q9BRD0 TMEM123-204ENST00000526676 467 ntTSL 418.54■□□□□ 0.562e-10■■■■■ 50.3
BUD13Q9BRD0 CIPC-203ENST00000554658 584 ntTSL 416.97■□□□□ 0.312e-10■■■■■ 50.3
BUD13Q9BRD0 JARID2-203ENST00000474854 520 ntTSL 316.23■□□□□ 0.192e-10■■■■■ 50.3
BUD13Q9BRD0 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.132e-10■■■■■ 50.3
BUD13Q9BRD0 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.132e-10■■■■■ 50.3
BUD13Q9BRD0 PLEKHA7-204ENST00000525177 673 ntTSL 215.76■□□□□ 0.112e-10■■■■■ 50.3
BUD13Q9BRD0 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.082e-10■■■■■ 50.3
BUD13Q9BRD0 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.072e-10■■■■■ 50.3
BUD13Q9BRD0 BZW2-209ENST00000437745 1711 ntTSL 1 (best)15.11■□□□□ 0.012e-10■■■■■ 50.3
BUD13Q9BRD0 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.082e-10■■■■■ 50.3
BUD13Q9BRD0 CIPC-202ENST00000554447 596 ntTSL 413.78□□□□□ -0.22e-10■■■■■ 50.3
BUD13Q9BRD0 TACC2-213ENST00000465600 3109 ntTSL 212.7□□□□□ -0.382e-10■■■■■ 50.3
BUD13Q9BRD0 CIPC-206ENST00000555611 599 ntTSL 4 BASIC12.18□□□□□ -0.462e-10■■■■■ 50.3
BUD13Q9BRD0 BZW2-214ENST00000630952 1721 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.472e-10■■■■■ 50.3
BUD13Q9BRD0 BZW2-203ENST00000407633 898 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.682e-10■■■■■ 50.3
BUD13Q9BRD0 CIPC-204ENST00000555200 581 ntTSL 310.62□□□□□ -0.712e-10■■■■■ 50.3
BUD13Q9BRD0 BZW2-207ENST00000433922 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.762e-10■■■■■ 50.3
BUD13Q9BRD0 BZW2-212ENST00000452975 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.782e-10■■■■■ 50.3
BUD13Q9BRD0 BZW2-202ENST00000405202 1689 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.782e-10■■■■■ 50.3
BUD13Q9BRD0 AC007375.2-201ENST00000557752 603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.792e-10■■■■■ 50.3
BUD13Q9BRD0 BZW2-201ENST00000258761 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.82e-10■■■■■ 50.3
BUD13Q9BRD0 BZW2-208ENST00000436868 1784 ntTSL 59.17□□□□□ -0.942e-10■■■■■ 50.3
BUD13Q9BRD0 TMEM123-207ENST00000531103 568 ntTSL 46.06□□□□□ -1.442e-10■■■■■ 50.3
BUD13Q9BRD0 KDM5B-204ENST00000456180 558 ntTSL 45.94□□□□□ -1.462e-10■■■■■ 50.3
BUD13Q9BRD0 TMEM123-205ENST00000528969 568 ntAPPRIS ALT2 TSL 45.19□□□□□ -1.582e-10■■■■■ 50.3
BUD13Q9BRD0 NISCH-211ENST00000488243 584 ntTSL 212.92□□□□□ -0.348e-14■■■■■ 49.3
BUD13Q9BRD0 RELT-204ENST00000539134 3244 ntTSL 213.78□□□□□ -0.21e-7■■■■■ 48.7
BUD13Q9BRD0 RELT-203ENST00000537771 768 ntTSL 312.42□□□□□ -0.421e-7■■■■■ 48.7
BUD13Q9BRD0 LPCAT4-205ENST00000563748 1357 ntTSL 218.4■□□□□ 0.541e-16■■■■■ 48.7
BUD13Q9BRD0 LPCAT4-207ENST00000567507 672 ntTSL 39.54□□□□□ -0.881e-16■■■■■ 48.7
BUD13Q9BRD0 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC8.04□□□□□ -1.123e-28■■■■■ 48.6
BUD13Q9BRD0 HBE1-201ENST00000292896 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.711e-12■■■■■ 48
BUD13Q9BRD0 HBE1-202ENST00000380237 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.761e-12■■■■■ 48
BUD13Q9BRD0 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC15.53■□□□□ 0.081e-23■■■■■ 47.8
Retrieved 100 of 53,381 protein–RNA pairs in 2924 ms