RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 NISCHQ9Y2I1 1504 aa27.41■■□□□ 1.98
NISCH-211ENST00000488243 ABCC9O60706 1549 aa24.92■■□□□ 1.58
NISCH-211ENST00000488243 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa24.46■■□□□ 1.51
NISCH-211ENST00000488243 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.95■■□□□ 1.42
NISCH-211ENST00000488243 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.47■■□□□ 1.35
NISCH-211ENST00000488243 NACADO15069 1562 aa23.2■■□□□ 1.3
NISCH-211ENST00000488243 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.17■■□□□ 1.3
NISCH-211ENST00000488243 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.14■■□□□ 1.291e-10■■■■□ 21.1
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NISCH-211ENST00000488243 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
NISCH-211ENST00000488243 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa22.81■■□□□ 1.24
NISCH-211ENST00000488243 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.8■■□□□ 1.24
NISCH-211ENST00000488243 MYO15BQ96JP2 1530 aa22.76■■□□□ 1.23
NISCH-211ENST00000488243 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.51■■□□□ 1.19
NISCH-211ENST00000488243 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.48■■□□□ 1.19
NISCH-211ENST00000488243 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.41■■□□□ 1.18
NISCH-211ENST00000488243 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa22.39■■□□□ 1.17
NISCH-211ENST00000488243 SCRIBQ14160 1630 aa22.35■■□□□ 1.17
NISCH-211ENST00000488243 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
NISCH-211ENST00000488243 CUX2O14529 1486 aa21.71■■□□□ 1.07
NISCH-211ENST00000488243 ERCC6Q03468 1493 aa21.56■■□□□ 1.04
NISCH-211ENST00000488243 NCAPD3P42695 1498 aa21.43■■□□□ 1.02
NISCH-211ENST00000488243 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.34■■□□□ 1.01
NISCH-211ENST00000488243 NESP48681 1621 aa21.27■■□□□ 1
NISCH-211ENST00000488243 SMARCA2P51531 1590 aa21.25■□□□□ 0.99
NISCH-211ENST00000488243 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
NISCH-211ENST00000488243 SMARCA4P51532 1647 aa21.24■□□□□ 0.99
NISCH-211ENST00000488243 HMGXB3Q12766 1538 aa21.24■□□□□ 0.99
NISCH-211ENST00000488243 TRIM41Q8WV44 630 aa21.2■□□□□ 0.98
NISCH-211ENST00000488243 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.98
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NISCH-211ENST00000488243 MROH2BQ7Z745 1585 aa21.08■□□□□ 0.97
NISCH-211ENST00000488243 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
NISCH-211ENST00000488243 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.01■□□□□ 0.95
NISCH-211ENST00000488243 PEG3Q9GZU2 1588 aa21■□□□□ 0.95
NISCH-211ENST00000488243 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa20.97■□□□□ 0.95
NISCH-211ENST00000488243 PDS5BQ9NTI5 1447 aa20.91■□□□□ 0.94
NISCH-211ENST00000488243 WIZO95785 1651 aa20.84■□□□□ 0.93
NISCH-211ENST00000488243 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
NISCH-211ENST00000488243 CADPSQ9ULU8 1353 aa20.79■□□□□ 0.92
NISCH-211ENST00000488243 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.76■□□□□ 0.91
NISCH-211ENST00000488243 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
NISCH-211ENST00000488243 WDR62O43379 1518 aa20.7■□□□□ 0.9
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NISCH-211ENST00000488243 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.62■□□□□ 0.89
NISCH-211ENST00000488243 FANCD2Q9BXW9 1451 aa20.57■□□□□ 0.88
NISCH-211ENST00000488243 CCDC88BA6NC98 1476 aa20.46■□□□□ 0.87
NISCH-211ENST00000488243 CFTRP13569 1480 aa20.46■□□□□ 0.87
NISCH-211ENST00000488243 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.42■□□□□ 0.86
NISCH-211ENST00000488243 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.42■□□□□ 0.86
NISCH-211ENST00000488243 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.42■□□□□ 0.86
NISCH-211ENST00000488243 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
NISCH-211ENST00000488243 ARHGEF11O15085 1522 aa20.3■□□□□ 0.84
NISCH-211ENST00000488243 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
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NISCH-211ENST00000488243 IFT140Q96RY7 1462 aa20.2■□□□□ 0.82
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NISCH-211ENST00000488243 TOPBP1Q92547 1522 aa20.14■□□□□ 0.81
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NISCH-211ENST00000488243 ABCC8Q09428 1581 aa20.03■□□□□ 0.8
NISCH-211ENST00000488243 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20.03■□□□□ 0.8
NISCH-211ENST00000488243 CHD1O14646 1710 aa20.02■□□□□ 0.8
NISCH-211ENST00000488243 FBLN2P98095 1184 aa20.01■□□□□ 0.79
NISCH-211ENST00000488243 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
NISCH-211ENST00000488243 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
NISCH-211ENST00000488243 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa19.88■□□□□ 0.77
NISCH-211ENST00000488243 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP19.85■□□□□ 0.77
NISCH-211ENST00000488243 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
NISCH-211ENST00000488243 SOGA1O94964 1423 aa19.83■□□□□ 0.76
NISCH-211ENST00000488243 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa19.8■□□□□ 0.76
NISCH-211ENST00000488243 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
NISCH-211ENST00000488243 TOP2BQ02880 1626 aa19.76■□□□□ 0.75
NISCH-211ENST00000488243 FGD5Q6ZNL6 1462 aa19.75■□□□□ 0.75
NISCH-211ENST00000488243 CHIC1Q5VXU3 224 aa19.75■□□□□ 0.75
NISCH-211ENST00000488243 CUX1P39880 1505 aa19.75■□□□□ 0.75
NISCH-211ENST00000488243 CLASP1Q7Z460 1538 aa19.75■□□□□ 0.75
NISCH-211ENST00000488243 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa19.74■□□□□ 0.75
NISCH-211ENST00000488243 SYNJ1O43426 1573 aa19.72■□□□□ 0.75
NISCH-211ENST00000488243 WDR97A6NE52 1622 aa19.69■□□□□ 0.74
NISCH-211ENST00000488243 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
NISCH-211ENST00000488243 GRIN2BQ13224 1484 aa19.67■□□□□ 0.74
NISCH-211ENST00000488243 SYNJ2O15056 1496 aa19.65■□□□□ 0.74
NISCH-211ENST00000488243 GAPVD1Q14C86 1478 aa19.6■□□□□ 0.73
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NISCH-211ENST00000488243 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa19.51■□□□□ 0.71
NISCH-211ENST00000488243 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa19.48■□□□□ 0.71
NISCH-211ENST00000488243 ERCC6L2Q5T890 1561 aa19.47■□□□□ 0.71
NISCH-211ENST00000488243 EEA1Q15075 1411 aa19.45■□□□□ 0.7
NISCH-211ENST00000488243 KIF27Q86VH2 1401 aa19.43■□□□□ 0.7
NISCH-211ENST00000488243 GRIN2AQ12879 1464 aa19.43■□□□□ 0.7
NISCH-211ENST00000488243 CEP170Q5SW79 1584 aa19.39■□□□□ 0.69
NISCH-211ENST00000488243 ADAMTS12P58397 1594 aa19.38■□□□□ 0.69
NISCH-211ENST00000488243 NUP160Q12769 1436 aa19.35■□□□□ 0.69
NISCH-211ENST00000488243 KIF13AQ9H1H9 1805 aa19.33■□□□□ 0.69
NISCH-211ENST00000488243 ERICH3Q5RHP9 1530 aa19.31■□□□□ 0.68
NISCH-211ENST00000488243 SHROOM2Q13796 1616 aa19.3■□□□□ 0.68
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