RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480665.1

TNS1-216, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 2

Gene TNS1, Length 758 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-216ENST00000480665 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.33■■■■□ 3.73
TNS1-216ENST00000480665 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.39■■■■□ 3.1
TNS1-216ENST00000480665 ABCC9O60706 1549 aa34.3■■■■□ 3.08
TNS1-216ENST00000480665 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.61■■■□□ 2.81
TNS1-216ENST00000480665 NACADO15069 1562 aa32.42■■■□□ 2.78
TNS1-216ENST00000480665 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.23■■■□□ 2.75
TNS1-216ENST00000480665 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.1■■■□□ 2.73
TNS1-216ENST00000480665 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.05■■■□□ 2.72
TNS1-216ENST00000480665 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32■■■□□ 2.71
TNS1-216ENST00000480665 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.89■■■□□ 2.7
TNS1-216ENST00000480665 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.87■■■□□ 2.69
TNS1-216ENST00000480665 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.84■■■□□ 2.69
TNS1-216ENST00000480665 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.67■■■□□ 2.66
TNS1-216ENST00000480665 SCRIBQ14160 1630 aa31.34■■■□□ 2.61
TNS1-216ENST00000480665 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.27■■■□□ 2.6
TNS1-216ENST00000480665 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.02■■■□□ 2.56
TNS1-216ENST00000480665 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.98■■■□□ 2.55
TNS1-216ENST00000480665 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.85■■■□□ 2.53
TNS1-216ENST00000480665 NCAPD3P42695 1498 aa29.96■■■□□ 2.39
TNS1-216ENST00000480665 SMARCA4P51532 1647 aa29.92■■■□□ 2.38
TNS1-216ENST00000480665 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.9■■■□□ 2.38
TNS1-216ENST00000480665 HMGXB3Q12766 1538 aa29.77■■■□□ 2.36
TNS1-216ENST00000480665 SMARCA2P51531 1590 aa29.74■■■□□ 2.35
TNS1-216ENST00000480665 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
TNS1-216ENST00000480665 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.66■■■□□ 2.34
TNS1-216ENST00000480665 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.59■■■□□ 2.33
TNS1-216ENST00000480665 NESP48681 1621 aa29.56■■■□□ 2.32
TNS1-216ENST00000480665 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
TNS1-216ENST00000480665 CUX2O14529 1486 aa29.48■■■□□ 2.31
TNS1-216ENST00000480665 ERCC6Q03468 1493 aa29.46■■■□□ 2.31
TNS1-216ENST00000480665 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.38■■■□□ 2.29
TNS1-216ENST00000480665 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
TNS1-216ENST00000480665 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.26■■■□□ 2.27
TNS1-216ENST00000480665 WIZO95785 1651 aa29.23■■■□□ 2.27
TNS1-216ENST00000480665 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.19■■■□□ 2.26
TNS1-216ENST00000480665 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.99■■■□□ 2.23
TNS1-216ENST00000480665 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.96■■■□□ 2.23
TNS1-216ENST00000480665 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
TNS1-216ENST00000480665 WDR62O43379 1518 aa28.84■■■□□ 2.21
TNS1-216ENST00000480665 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.83■■■□□ 2.21
TNS1-216ENST00000480665 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
TNS1-216ENST00000480665 CFTRP13569 1480 aa28.74■■■□□ 2.19
TNS1-216ENST00000480665 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.7■■■□□ 2.18
TNS1-216ENST00000480665 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.69■■■□□ 2.18
TNS1-216ENST00000480665 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
TNS1-216ENST00000480665 PRDM2Q13029 1718 aa28.52■■■□□ 2.16
TNS1-216ENST00000480665 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.48■■■□□ 2.15
TNS1-216ENST00000480665 TOPBP1Q92547 1522 aa28.21■■■□□ 2.11
TNS1-216ENST00000480665 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
TNS1-216ENST00000480665 IFT140Q96RY7 1462 aa28.12■■■□□ 2.09
TNS1-216ENST00000480665 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.09■■■□□ 2.09
TNS1-216ENST00000480665 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
TNS1-216ENST00000480665 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
TNS1-216ENST00000480665 TRIM41Q8WV44 630 aa28.01■■■□□ 2.07
TNS1-216ENST00000480665 OSCARQ8IYS5 282 aa27.99■■■□□ 2.07
TNS1-216ENST00000480665 ABCC8Q09428 1581 aa27.98■■■□□ 2.07
TNS1-216ENST00000480665 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
TNS1-216ENST00000480665 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.88■■■□□ 2.05
TNS1-216ENST00000480665 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.88■■■□□ 2.05
TNS1-216ENST00000480665 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.88■■■□□ 2.05
TNS1-216ENST00000480665 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.87■■■□□ 2.054e-10■■■■□ 24.6
TNS1-216ENST00000480665 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.83■■■□□ 2.04
TNS1-216ENST00000480665 CHD1O14646 1710 aa27.82■■■□□ 2.04
TNS1-216ENST00000480665 CUX1P39880 1505 aa27.79■■■□□ 2.04
TNS1-216ENST00000480665 ARHGEF11O15085 1522 aa27.77■■■□□ 2.04
TNS1-216ENST00000480665 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.75■■■□□ 2.03
TNS1-216ENST00000480665 SOGA1O94964 1423 aa27.68■■■□□ 2.02
TNS1-216ENST00000480665 WDR97A6NE52 1622 aa27.68■■■□□ 2.02
TNS1-216ENST00000480665 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
TNS1-216ENST00000480665 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.59■■■□□ 2.01
TNS1-216ENST00000480665 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.54■■■□□ 2
TNS1-216ENST00000480665 ARAP1Q96P48 1450 aa27.54■■■□□ 2
TNS1-216ENST00000480665 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
TNS1-216ENST00000480665 PBRM1Q86U86 1689 aa27.48■■□□□ 1.99
TNS1-216ENST00000480665 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
TNS1-216ENST00000480665 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.47■■□□□ 1.99
TNS1-216ENST00000480665 GRIN2BQ13224 1484 aa27.46■■□□□ 1.99
TNS1-216ENST00000480665 FBLN2P98095 1184 aa27.44■■□□□ 1.98
TNS1-216ENST00000480665 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.43■■□□□ 1.98
TNS1-216ENST00000480665 SYNJ2O15056 1496 aa27.39■■□□□ 1.98
TNS1-216ENST00000480665 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.38■■□□□ 1.97
TNS1-216ENST00000480665 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.37■■□□□ 1.97
TNS1-216ENST00000480665 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.36■■□□□ 1.97
TNS1-216ENST00000480665 SYNJ1O43426 1573 aa27.35■■□□□ 1.97
TNS1-216ENST00000480665 TOP2BQ02880 1626 aa27.31■■□□□ 1.96
TNS1-216ENST00000480665 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
TNS1-216ENST00000480665 ADAMTS12P58397 1594 aa27.23■■□□□ 1.95
TNS1-216ENST00000480665 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.22■■□□□ 1.95
TNS1-216ENST00000480665 GRIN2AQ12879 1464 aa27.17■■□□□ 1.94
TNS1-216ENST00000480665 CEP170Q5SW79 1584 aa27.16■■□□□ 1.94
TNS1-216ENST00000480665 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.16■■□□□ 1.94
TNS1-216ENST00000480665 NUP160Q12769 1436 aa27.12■■□□□ 1.93
TNS1-216ENST00000480665 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.06■■□□□ 1.92
TNS1-216ENST00000480665 SHROOM2Q13796 1616 aa27.05■■□□□ 1.92
TNS1-216ENST00000480665 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.03■■□□□ 1.92
TNS1-216ENST00000480665 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
TNS1-216ENST00000480665 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.87■■□□□ 1.89
TNS1-216ENST00000480665 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
TNS1-216ENST00000480665 IGF1RP08069 1367 aa26.71■■□□□ 1.87
TNS1-216ENST00000480665 CUL7Q14999 1698 aa26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms