RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557115.5

CIPC-208, Transcript of CLOCK interacting pacemaker, humanhuman

TSL 4

Gene CIPC, Length 882 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPC-208ENST00000557115 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.65■■■■■ 6.18
CIPC-208ENST00000557115 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.92■■■■■ 5.26
CIPC-208ENST00000557115 ABCC9O60706 1549 aa47.77■■■■■ 5.24
CIPC-208ENST00000557115 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.56■■■■■ 4.88
CIPC-208ENST00000557115 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.41■■■■■ 4.86
CIPC-208ENST00000557115 NACADO15069 1562 aa45.31■■■■■ 4.84
CIPC-208ENST00000557115 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.75■■■■■ 4.75
CIPC-208ENST00000557115 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.6■■■■■ 4.73
CIPC-208ENST00000557115 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.51■■■■■ 4.72
CIPC-208ENST00000557115 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.5■■■■■ 4.71
CIPC-208ENST00000557115 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.37■■■■■ 4.69
CIPC-208ENST00000557115 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.29■■■■■ 4.68
CIPC-208ENST00000557115 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.13■■■■■ 4.65
CIPC-208ENST00000557115 SCRIBQ14160 1630 aa43.79■■■■■ 4.6
CIPC-208ENST00000557115 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.62■■■■■ 4.57
CIPC-208ENST00000557115 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.1■■■■■ 4.49
CIPC-208ENST00000557115 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.08■■■■■ 4.49
CIPC-208ENST00000557115 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.99■■■■■ 4.47
CIPC-208ENST00000557115 NCAPD3P42695 1498 aa41.84■■■■■ 4.29
CIPC-208ENST00000557115 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.77■■■■■ 4.28
CIPC-208ENST00000557115 SMARCA4P51532 1647 aa41.76■■■■■ 4.28
CIPC-208ENST00000557115 SMARCA2P51531 1590 aa41.67■■■■■ 4.26
CIPC-208ENST00000557115 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.64■■■■■ 4.26
CIPC-208ENST00000557115 HMGXB3Q12766 1538 aa41.52■■■■■ 4.24
CIPC-208ENST00000557115 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.42■■■■■ 4.22
CIPC-208ENST00000557115 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.35■■■■■ 4.21
CIPC-208ENST00000557115 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.31■■■■■ 4.2
CIPC-208ENST00000557115 ERCC6Q03468 1493 aa41.28■■■■■ 4.2
CIPC-208ENST00000557115 NESP48681 1621 aa41.09■■■■■ 4.17
CIPC-208ENST00000557115 CUX2O14529 1486 aa41.01■■■■■ 4.16
CIPC-208ENST00000557115 WIZO95785 1651 aa40.85■■■■■ 4.13
CIPC-208ENST00000557115 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.82■■■■■ 4.13
CIPC-208ENST00000557115 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.67■■■■■ 4.1
CIPC-208ENST00000557115 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.67■■■■■ 4.1
CIPC-208ENST00000557115 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.64■■■■■ 4.1
CIPC-208ENST00000557115 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.63■■■■■ 4.1
CIPC-208ENST00000557115 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.52■■■■■ 4.08
CIPC-208ENST00000557115 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.49■■■■■ 4.07
CIPC-208ENST00000557115 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.37■■■■■ 4.05
CIPC-208ENST00000557115 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.26■■■■■ 4.03
CIPC-208ENST00000557115 CFTRP13569 1480 aa40.19■■■■■ 4.03
CIPC-208ENST00000557115 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.19■■■■■ 4.02
CIPC-208ENST00000557115 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.17■■■■■ 4.02
CIPC-208ENST00000557115 WDR62O43379 1518 aa40.09■■■■■ 4.01
CIPC-208ENST00000557115 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.94■■■■□ 3.98
CIPC-208ENST00000557115 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.76■■■■□ 3.96
CIPC-208ENST00000557115 PRDM2Q13029 1718 aa39.68■■■■□ 3.94
CIPC-208ENST00000557115 TOPBP1Q92547 1522 aa39.41■■■■□ 3.9
CIPC-208ENST00000557115 ABCC8Q09428 1581 aa39.38■■■■□ 3.89
CIPC-208ENST00000557115 IFT140Q96RY7 1462 aa39.37■■■■□ 3.89
CIPC-208ENST00000557115 OSCARQ8IYS5 282 aa39.31■■■■□ 3.88
CIPC-208ENST00000557115 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.28■■■■□ 3.88
CIPC-208ENST00000557115 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.25■■■■□ 3.87
CIPC-208ENST00000557115 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.24■■■■□ 3.87
CIPC-208ENST00000557115 TRIM41Q8WV44 630 aa39.13■■■■□ 3.85
CIPC-208ENST00000557115 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.03■■■■□ 3.84
CIPC-208ENST00000557115 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.99■■■■□ 3.83
CIPC-208ENST00000557115 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.97■■■■□ 3.832e-11■■■■□ 26
CIPC-208ENST00000557115 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.96■■■■□ 3.83
CIPC-208ENST00000557115 SOGA1O94964 1423 aa38.92■■■■□ 3.82
CIPC-208ENST00000557115 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.91■■■■□ 3.82
CIPC-208ENST00000557115 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.85■■■■□ 3.81
CIPC-208ENST00000557115 CUX1P39880 1505 aa38.84■■■■□ 3.81
CIPC-208ENST00000557115 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.82■■■■□ 3.8
CIPC-208ENST00000557115 FBLN2P98095 1184 aa38.79■■■■□ 3.8
CIPC-208ENST00000557115 CHD1O14646 1710 aa38.61■■■■□ 3.77
CIPC-208ENST00000557115 WDR97A6NE52 1622 aa38.6■■■■□ 3.77
CIPC-208ENST00000557115 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.6■■■■□ 3.77
CIPC-208ENST00000557115 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.6■■■■□ 3.77
CIPC-208ENST00000557115 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.6■■■■□ 3.77
CIPC-208ENST00000557115 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.57■■■■□ 3.76
CIPC-208ENST00000557115 ARHGEF11O15085 1522 aa38.55■■■■□ 3.76
CIPC-208ENST00000557115 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.52■■■■□ 3.76
CIPC-208ENST00000557115 GRIN2BQ13224 1484 aa38.52■■■■□ 3.76
CIPC-208ENST00000557115 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.47■■■■□ 3.75
CIPC-208ENST00000557115 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.44■■■■□ 3.74
CIPC-208ENST00000557115 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.41■■■■□ 3.74
CIPC-208ENST00000557115 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.38■■■■□ 3.74
CIPC-208ENST00000557115 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.38■■■■□ 3.73
CIPC-208ENST00000557115 SYNJ2O15056 1496 aa38.34■■■■□ 3.73
CIPC-208ENST00000557115 PBRM1Q86U86 1689 aa38.28■■■■□ 3.72
CIPC-208ENST00000557115 SYNJ1O43426 1573 aa38.27■■■■□ 3.72
CIPC-208ENST00000557115 TOP2BQ02880 1626 aa38.27■■■■□ 3.72
CIPC-208ENST00000557115 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.26■■■■□ 3.71
CIPC-208ENST00000557115 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.23■■■■□ 3.71
CIPC-208ENST00000557115 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.2■■■■□ 3.71
CIPC-208ENST00000557115 ARAP1Q96P48 1450 aa38.19■■■■□ 3.7
CIPC-208ENST00000557115 GRIN2AQ12879 1464 aa38■■■■□ 3.67
CIPC-208ENST00000557115 ADAMTS12P58397 1594 aa37.97■■■■□ 3.67
CIPC-208ENST00000557115 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.96■■■■□ 3.67
CIPC-208ENST00000557115 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.92■■■■□ 3.66
CIPC-208ENST00000557115 TRHP20396 242 aaPredicted RBP37.91■■■■□ 3.66
CIPC-208ENST00000557115 NUP160Q12769 1436 aa37.84■■■■□ 3.65
CIPC-208ENST00000557115 CEP170Q5SW79 1584 aa37.8■■■■□ 3.64
CIPC-208ENST00000557115 KIF27Q86VH2 1401 aa37.65■■■■□ 3.62
CIPC-208ENST00000557115 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.64■■■■□ 3.62
CIPC-208ENST00000557115 JPH4Q96JJ6 628 aa37.57■■■■□ 3.6
CIPC-208ENST00000557115 IGF1RP08069 1367 aa37.56■■■■□ 3.6
CIPC-208ENST00000557115 SHROOM2Q13796 1616 aa37.56■■■■□ 3.6
CIPC-208ENST00000557115 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.53■■■■□ 3.6
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