Protein–RNA interactions for Protein: Q96S82

UBL7, Ubiquitin-like protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL7Q96S82 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
UBL7Q96S82 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
UBL7Q96S82 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
UBL7Q96S82 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBL7Q96S82 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
UBL7Q96S82 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
UBL7Q96S82 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
UBL7Q96S82 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
UBL7Q96S82 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
UBL7Q96S82 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
UBL7Q96S82 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
UBL7Q96S82 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
UBL7Q96S82 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
UBL7Q96S82 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
UBL7Q96S82 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
UBL7Q96S82 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
UBL7Q96S82 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
UBL7Q96S82 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
UBL7Q96S82 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBL7Q96S82 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBL7Q96S82 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBL7Q96S82 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
UBL7Q96S82 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
UBL7Q96S82 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBL7Q96S82 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBL7Q96S82 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBL7Q96S82 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
UBL7Q96S82 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBL7Q96S82 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
UBL7Q96S82 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
UBL7Q96S82 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBL7Q96S82 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBL7Q96S82 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
UBL7Q96S82 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBL7Q96S82 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
UBL7Q96S82 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBL7Q96S82 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBL7Q96S82 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBL7Q96S82 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBL7Q96S82 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBL7Q96S82 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBL7Q96S82 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBL7Q96S82 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBL7Q96S82 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBL7Q96S82 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBL7Q96S82 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBL7Q96S82 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
UBL7Q96S82 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBL7Q96S82 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBL7Q96S82 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBL7Q96S82 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBL7Q96S82 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBL7Q96S82 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBL7Q96S82 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBL7Q96S82 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBL7Q96S82 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBL7Q96S82 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBL7Q96S82 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBL7Q96S82 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBL7Q96S82 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBL7Q96S82 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBL7Q96S82 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBL7Q96S82 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBL7Q96S82 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBL7Q96S82 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
UBL7Q96S82 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBL7Q96S82 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBL7Q96S82 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBL7Q96S82 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBL7Q96S82 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
UBL7Q96S82 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
UBL7Q96S82 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBL7Q96S82 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBL7Q96S82 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBL7Q96S82 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBL7Q96S82 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
UBL7Q96S82 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBL7Q96S82 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBL7Q96S82 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBL7Q96S82 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
UBL7Q96S82 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBL7Q96S82 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBL7Q96S82 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBL7Q96S82 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
UBL7Q96S82 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
UBL7Q96S82 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBL7Q96S82 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBL7Q96S82 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBL7Q96S82 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UBL7Q96S82 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UBL7Q96S82 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBL7Q96S82 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBL7Q96S82 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBL7Q96S82 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBL7Q96S82 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBL7Q96S82 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBL7Q96S82 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBL7Q96S82 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
UBL7Q96S82 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBL7Q96S82 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms