Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG31

KNL1, Kinetochore scaffold 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNL1Q8NG31 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KNL1Q8NG31 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KNL1Q8NG31 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KNL1Q8NG31 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
KNL1Q8NG31 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KNL1Q8NG31 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KNL1Q8NG31 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KNL1Q8NG31 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KNL1Q8NG31 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KNL1Q8NG31 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KNL1Q8NG31 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KNL1Q8NG31 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
KNL1Q8NG31 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KNL1Q8NG31 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KNL1Q8NG31 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KNL1Q8NG31 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KNL1Q8NG31 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KNL1Q8NG31 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KNL1Q8NG31 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
KNL1Q8NG31 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KNL1Q8NG31 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
KNL1Q8NG31 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KNL1Q8NG31 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KNL1Q8NG31 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KNL1Q8NG31 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KNL1Q8NG31 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KNL1Q8NG31 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KNL1Q8NG31 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KNL1Q8NG31 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KNL1Q8NG31 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KNL1Q8NG31 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KNL1Q8NG31 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KNL1Q8NG31 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KNL1Q8NG31 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KNL1Q8NG31 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KNL1Q8NG31 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KNL1Q8NG31 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KNL1Q8NG31 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KNL1Q8NG31 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KNL1Q8NG31 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KNL1Q8NG31 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KNL1Q8NG31 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KNL1Q8NG31 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
KNL1Q8NG31 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KNL1Q8NG31 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KNL1Q8NG31 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
KNL1Q8NG31 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KNL1Q8NG31 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KNL1Q8NG31 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KNL1Q8NG31 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KNL1Q8NG31 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KNL1Q8NG31 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KNL1Q8NG31 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
KNL1Q8NG31 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KNL1Q8NG31 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
KNL1Q8NG31 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KNL1Q8NG31 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
KNL1Q8NG31 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KNL1Q8NG31 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KNL1Q8NG31 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
KNL1Q8NG31 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KNL1Q8NG31 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KNL1Q8NG31 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KNL1Q8NG31 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
KNL1Q8NG31 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KNL1Q8NG31 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KNL1Q8NG31 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KNL1Q8NG31 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KNL1Q8NG31 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KNL1Q8NG31 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KNL1Q8NG31 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KNL1Q8NG31 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KNL1Q8NG31 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KNL1Q8NG31 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KNL1Q8NG31 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KNL1Q8NG31 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KNL1Q8NG31 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KNL1Q8NG31 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KNL1Q8NG31 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KNL1Q8NG31 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KNL1Q8NG31 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KNL1Q8NG31 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KNL1Q8NG31 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KNL1Q8NG31 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KNL1Q8NG31 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KNL1Q8NG31 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KNL1Q8NG31 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KNL1Q8NG31 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KNL1Q8NG31 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KNL1Q8NG31 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KNL1Q8NG31 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KNL1Q8NG31 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
KNL1Q8NG31 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KNL1Q8NG31 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KNL1Q8NG31 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
KNL1Q8NG31 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KNL1Q8NG31 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KNL1Q8NG31 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KNL1Q8NG31 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KNL1Q8NG31 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms