Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4K4

RPRML, Reprimo-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRMLQ8N4K4 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPRMLQ8N4K4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPRMLQ8N4K4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPRMLQ8N4K4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPRMLQ8N4K4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPRMLQ8N4K4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPRMLQ8N4K4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPRMLQ8N4K4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPRMLQ8N4K4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPRMLQ8N4K4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPRMLQ8N4K4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPRMLQ8N4K4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPRMLQ8N4K4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPRMLQ8N4K4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPRMLQ8N4K4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPRMLQ8N4K4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPRMLQ8N4K4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPRMLQ8N4K4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPRMLQ8N4K4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPRMLQ8N4K4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPRMLQ8N4K4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPRMLQ8N4K4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPRMLQ8N4K4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPRMLQ8N4K4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPRMLQ8N4K4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPRMLQ8N4K4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPRMLQ8N4K4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPRMLQ8N4K4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPRMLQ8N4K4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPRMLQ8N4K4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPRMLQ8N4K4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RPRMLQ8N4K4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPRMLQ8N4K4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPRMLQ8N4K4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPRMLQ8N4K4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RPRMLQ8N4K4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPRMLQ8N4K4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPRMLQ8N4K4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPRMLQ8N4K4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RPRMLQ8N4K4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPRMLQ8N4K4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPRMLQ8N4K4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPRMLQ8N4K4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPRMLQ8N4K4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPRMLQ8N4K4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPRMLQ8N4K4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPRMLQ8N4K4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPRMLQ8N4K4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPRMLQ8N4K4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPRMLQ8N4K4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RPRMLQ8N4K4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RPRMLQ8N4K4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPRMLQ8N4K4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPRMLQ8N4K4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RPRMLQ8N4K4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPRMLQ8N4K4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RPRMLQ8N4K4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPRMLQ8N4K4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPRMLQ8N4K4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPRMLQ8N4K4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPRMLQ8N4K4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPRMLQ8N4K4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPRMLQ8N4K4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPRMLQ8N4K4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPRMLQ8N4K4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPRMLQ8N4K4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPRMLQ8N4K4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RPRMLQ8N4K4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPRMLQ8N4K4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPRMLQ8N4K4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPRMLQ8N4K4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPRMLQ8N4K4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPRMLQ8N4K4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPRMLQ8N4K4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPRMLQ8N4K4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPRMLQ8N4K4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPRMLQ8N4K4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPRMLQ8N4K4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPRMLQ8N4K4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPRMLQ8N4K4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPRMLQ8N4K4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPRMLQ8N4K4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPRMLQ8N4K4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPRMLQ8N4K4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPRMLQ8N4K4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPRMLQ8N4K4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPRMLQ8N4K4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPRMLQ8N4K4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPRMLQ8N4K4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPRMLQ8N4K4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPRMLQ8N4K4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPRMLQ8N4K4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPRMLQ8N4K4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RPRMLQ8N4K4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RPRMLQ8N4K4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RPRMLQ8N4K4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPRMLQ8N4K4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPRMLQ8N4K4 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPRMLQ8N4K4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPRMLQ8N4K4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms