Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PDCL2Q8N4E4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PDCL2Q8N4E4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
PDCL2Q8N4E4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.71
PDCL2Q8N4E4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PDCL2Q8N4E4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PDCL2Q8N4E4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
PDCL2Q8N4E4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PDCL2Q8N4E4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PDCL2Q8N4E4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PDCL2Q8N4E4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PDCL2Q8N4E4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PDCL2Q8N4E4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PDCL2Q8N4E4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PDCL2Q8N4E4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PDCL2Q8N4E4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PDCL2Q8N4E4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PDCL2Q8N4E4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
PDCL2Q8N4E4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
PDCL2Q8N4E4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PDCL2Q8N4E4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PDCL2Q8N4E4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PDCL2Q8N4E4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PDCL2Q8N4E4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PDCL2Q8N4E4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PDCL2Q8N4E4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PDCL2Q8N4E4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PDCL2Q8N4E4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PDCL2Q8N4E4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PDCL2Q8N4E4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PDCL2Q8N4E4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PDCL2Q8N4E4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PDCL2Q8N4E4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PDCL2Q8N4E4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PDCL2Q8N4E4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PDCL2Q8N4E4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PDCL2Q8N4E4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PDCL2Q8N4E4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PDCL2Q8N4E4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PDCL2Q8N4E4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PDCL2Q8N4E4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PDCL2Q8N4E4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PDCL2Q8N4E4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PDCL2Q8N4E4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PDCL2Q8N4E4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
PDCL2Q8N4E4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PDCL2Q8N4E4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PDCL2Q8N4E4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PDCL2Q8N4E4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PDCL2Q8N4E4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PDCL2Q8N4E4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
PDCL2Q8N4E4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
PDCL2Q8N4E4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
PDCL2Q8N4E4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PDCL2Q8N4E4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PDCL2Q8N4E4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PDCL2Q8N4E4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PDCL2Q8N4E4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PDCL2Q8N4E4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PDCL2Q8N4E4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PDCL2Q8N4E4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PDCL2Q8N4E4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PDCL2Q8N4E4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PDCL2Q8N4E4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PDCL2Q8N4E4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PDCL2Q8N4E4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PDCL2Q8N4E4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PDCL2Q8N4E4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PDCL2Q8N4E4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PDCL2Q8N4E4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
PDCL2Q8N4E4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PDCL2Q8N4E4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PDCL2Q8N4E4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PDCL2Q8N4E4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PDCL2Q8N4E4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PDCL2Q8N4E4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PDCL2Q8N4E4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
PDCL2Q8N4E4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PDCL2Q8N4E4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
PDCL2Q8N4E4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PDCL2Q8N4E4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PDCL2Q8N4E4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PDCL2Q8N4E4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PDCL2Q8N4E4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PDCL2Q8N4E4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PDCL2Q8N4E4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PDCL2Q8N4E4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PDCL2Q8N4E4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PDCL2Q8N4E4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PDCL2Q8N4E4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PDCL2Q8N4E4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PDCL2Q8N4E4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PDCL2Q8N4E4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PDCL2Q8N4E4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PDCL2Q8N4E4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
PDCL2Q8N4E4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PDCL2Q8N4E4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PDCL2Q8N4E4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PDCL2Q8N4E4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PDCL2Q8N4E4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms