Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC37.18■■■■□ 3.54
PDCL2Q8N4E4 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.77■■■■□ 3.48
PDCL2Q8N4E4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
PDCL2Q8N4E4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PDCL2Q8N4E4 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
PDCL2Q8N4E4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PDCL2Q8N4E4 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
PDCL2Q8N4E4 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
PDCL2Q8N4E4 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
PDCL2Q8N4E4 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
PDCL2Q8N4E4 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
PDCL2Q8N4E4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
PDCL2Q8N4E4 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
PDCL2Q8N4E4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
PDCL2Q8N4E4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
PDCL2Q8N4E4 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PDCL2Q8N4E4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
PDCL2Q8N4E4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PDCL2Q8N4E4 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PDCL2Q8N4E4 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PDCL2Q8N4E4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PDCL2Q8N4E4 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PDCL2Q8N4E4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PDCL2Q8N4E4 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PDCL2Q8N4E4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PDCL2Q8N4E4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PDCL2Q8N4E4 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PDCL2Q8N4E4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PDCL2Q8N4E4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PDCL2Q8N4E4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PDCL2Q8N4E4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PDCL2Q8N4E4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PDCL2Q8N4E4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PDCL2Q8N4E4 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
PDCL2Q8N4E4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PDCL2Q8N4E4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PDCL2Q8N4E4 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PDCL2Q8N4E4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PDCL2Q8N4E4 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PDCL2Q8N4E4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PDCL2Q8N4E4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PDCL2Q8N4E4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PDCL2Q8N4E4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PDCL2Q8N4E4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PDCL2Q8N4E4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PDCL2Q8N4E4 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PDCL2Q8N4E4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PDCL2Q8N4E4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PDCL2Q8N4E4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PDCL2Q8N4E4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PDCL2Q8N4E4 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
PDCL2Q8N4E4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PDCL2Q8N4E4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PDCL2Q8N4E4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PDCL2Q8N4E4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PDCL2Q8N4E4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PDCL2Q8N4E4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PDCL2Q8N4E4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PDCL2Q8N4E4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PDCL2Q8N4E4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PDCL2Q8N4E4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PDCL2Q8N4E4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PDCL2Q8N4E4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PDCL2Q8N4E4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PDCL2Q8N4E4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PDCL2Q8N4E4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PDCL2Q8N4E4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PDCL2Q8N4E4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PDCL2Q8N4E4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PDCL2Q8N4E4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PDCL2Q8N4E4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PDCL2Q8N4E4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PDCL2Q8N4E4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PDCL2Q8N4E4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PDCL2Q8N4E4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PDCL2Q8N4E4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PDCL2Q8N4E4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PDCL2Q8N4E4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
PDCL2Q8N4E4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PDCL2Q8N4E4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PDCL2Q8N4E4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PDCL2Q8N4E4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PDCL2Q8N4E4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PDCL2Q8N4E4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PDCL2Q8N4E4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PDCL2Q8N4E4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PDCL2Q8N4E4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PDCL2Q8N4E4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PDCL2Q8N4E4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PDCL2Q8N4E4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PDCL2Q8N4E4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PDCL2Q8N4E4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PDCL2Q8N4E4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PDCL2Q8N4E4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PDCL2Q8N4E4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PDCL2Q8N4E4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.73
PDCL2Q8N4E4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
PDCL2Q8N4E4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
PDCL2Q8N4E4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PDCL2Q8N4E4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms