Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z333

SETX, Probable helicase senataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETXQ7Z333 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SETXQ7Z333 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SETXQ7Z333 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SETXQ7Z333 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SETXQ7Z333 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SETXQ7Z333 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SETXQ7Z333 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SETXQ7Z333 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SETXQ7Z333 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SETXQ7Z333 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SETXQ7Z333 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SETXQ7Z333 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SETXQ7Z333 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SETXQ7Z333 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SETXQ7Z333 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SETXQ7Z333 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SETXQ7Z333 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SETXQ7Z333 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SETXQ7Z333 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SETXQ7Z333 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SETXQ7Z333 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SETXQ7Z333 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SETXQ7Z333 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SETXQ7Z333 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SETXQ7Z333 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SETXQ7Z333 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SETXQ7Z333 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SETXQ7Z333 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SETXQ7Z333 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SETXQ7Z333 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SETXQ7Z333 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SETXQ7Z333 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SETXQ7Z333 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SETXQ7Z333 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SETXQ7Z333 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SETXQ7Z333 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SETXQ7Z333 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SETXQ7Z333 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SETXQ7Z333 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SETXQ7Z333 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SETXQ7Z333 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SETXQ7Z333 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SETXQ7Z333 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SETXQ7Z333 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SETXQ7Z333 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SETXQ7Z333 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
SETXQ7Z333 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SETXQ7Z333 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SETXQ7Z333 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SETXQ7Z333 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
SETXQ7Z333 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SETXQ7Z333 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SETXQ7Z333 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SETXQ7Z333 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SETXQ7Z333 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SETXQ7Z333 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SETXQ7Z333 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SETXQ7Z333 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SETXQ7Z333 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SETXQ7Z333 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SETXQ7Z333 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SETXQ7Z333 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SETXQ7Z333 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SETXQ7Z333 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SETXQ7Z333 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SETXQ7Z333 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SETXQ7Z333 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SETXQ7Z333 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SETXQ7Z333 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SETXQ7Z333 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SETXQ7Z333 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SETXQ7Z333 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SETXQ7Z333 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SETXQ7Z333 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SETXQ7Z333 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SETXQ7Z333 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SETXQ7Z333 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SETXQ7Z333 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SETXQ7Z333 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SETXQ7Z333 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SETXQ7Z333 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SETXQ7Z333 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SETXQ7Z333 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SETXQ7Z333 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SETXQ7Z333 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SETXQ7Z333 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SETXQ7Z333 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SETXQ7Z333 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SETXQ7Z333 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SETXQ7Z333 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SETXQ7Z333 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SETXQ7Z333 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SETXQ7Z333 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SETXQ7Z333 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SETXQ7Z333 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SETXQ7Z333 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SETXQ7Z333 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SETXQ7Z333 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SETXQ7Z333 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SETXQ7Z333 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms