Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
PDZRN4Q6ZMN7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PDZRN4Q6ZMN7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PDZRN4Q6ZMN7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PDZRN4Q6ZMN7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PDZRN4Q6ZMN7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PDZRN4Q6ZMN7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PDZRN4Q6ZMN7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
PDZRN4Q6ZMN7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PDZRN4Q6ZMN7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PDZRN4Q6ZMN7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PDZRN4Q6ZMN7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PDZRN4Q6ZMN7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
PDZRN4Q6ZMN7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PDZRN4Q6ZMN7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PDZRN4Q6ZMN7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PDZRN4Q6ZMN7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PDZRN4Q6ZMN7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PDZRN4Q6ZMN7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PDZRN4Q6ZMN7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PDZRN4Q6ZMN7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PDZRN4Q6ZMN7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PDZRN4Q6ZMN7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PDZRN4Q6ZMN7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PDZRN4Q6ZMN7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PDZRN4Q6ZMN7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PDZRN4Q6ZMN7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PDZRN4Q6ZMN7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PDZRN4Q6ZMN7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PDZRN4Q6ZMN7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PDZRN4Q6ZMN7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PDZRN4Q6ZMN7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PDZRN4Q6ZMN7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PDZRN4Q6ZMN7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PDZRN4Q6ZMN7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PDZRN4Q6ZMN7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PDZRN4Q6ZMN7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PDZRN4Q6ZMN7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PDZRN4Q6ZMN7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PDZRN4Q6ZMN7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
PDZRN4Q6ZMN7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PDZRN4Q6ZMN7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PDZRN4Q6ZMN7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PDZRN4Q6ZMN7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PDZRN4Q6ZMN7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PDZRN4Q6ZMN7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PDZRN4Q6ZMN7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PDZRN4Q6ZMN7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PDZRN4Q6ZMN7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PDZRN4Q6ZMN7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
PDZRN4Q6ZMN7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PDZRN4Q6ZMN7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PDZRN4Q6ZMN7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PDZRN4Q6ZMN7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PDZRN4Q6ZMN7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PDZRN4Q6ZMN7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PDZRN4Q6ZMN7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PDZRN4Q6ZMN7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PDZRN4Q6ZMN7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PDZRN4Q6ZMN7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PDZRN4Q6ZMN7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PDZRN4Q6ZMN7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PDZRN4Q6ZMN7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PDZRN4Q6ZMN7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PDZRN4Q6ZMN7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PDZRN4Q6ZMN7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PDZRN4Q6ZMN7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PDZRN4Q6ZMN7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PDZRN4Q6ZMN7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PDZRN4Q6ZMN7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PDZRN4Q6ZMN7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PDZRN4Q6ZMN7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PDZRN4Q6ZMN7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PDZRN4Q6ZMN7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PDZRN4Q6ZMN7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
PDZRN4Q6ZMN7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PDZRN4Q6ZMN7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PDZRN4Q6ZMN7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PDZRN4Q6ZMN7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
PDZRN4Q6ZMN7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PDZRN4Q6ZMN7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PDZRN4Q6ZMN7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PDZRN4Q6ZMN7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PDZRN4Q6ZMN7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PDZRN4Q6ZMN7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PDZRN4Q6ZMN7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PDZRN4Q6ZMN7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PDZRN4Q6ZMN7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PDZRN4Q6ZMN7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PDZRN4Q6ZMN7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PDZRN4Q6ZMN7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PDZRN4Q6ZMN7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PDZRN4Q6ZMN7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PDZRN4Q6ZMN7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PDZRN4Q6ZMN7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PDZRN4Q6ZMN7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
PDZRN4Q6ZMN7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PDZRN4Q6ZMN7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PDZRN4Q6ZMN7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms