Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMB0

B3GNT6, Acetylgalactosaminyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3GNT6Q6ZMB0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
B3GNT6Q6ZMB0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
B3GNT6Q6ZMB0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
B3GNT6Q6ZMB0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
B3GNT6Q6ZMB0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
B3GNT6Q6ZMB0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
B3GNT6Q6ZMB0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
B3GNT6Q6ZMB0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
B3GNT6Q6ZMB0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
B3GNT6Q6ZMB0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
B3GNT6Q6ZMB0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
B3GNT6Q6ZMB0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
B3GNT6Q6ZMB0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
B3GNT6Q6ZMB0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
B3GNT6Q6ZMB0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
B3GNT6Q6ZMB0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
B3GNT6Q6ZMB0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
B3GNT6Q6ZMB0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
B3GNT6Q6ZMB0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
B3GNT6Q6ZMB0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
B3GNT6Q6ZMB0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
B3GNT6Q6ZMB0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
B3GNT6Q6ZMB0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
B3GNT6Q6ZMB0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
B3GNT6Q6ZMB0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
B3GNT6Q6ZMB0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
B3GNT6Q6ZMB0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
B3GNT6Q6ZMB0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
B3GNT6Q6ZMB0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
B3GNT6Q6ZMB0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
B3GNT6Q6ZMB0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
B3GNT6Q6ZMB0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
B3GNT6Q6ZMB0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
B3GNT6Q6ZMB0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
B3GNT6Q6ZMB0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
B3GNT6Q6ZMB0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
B3GNT6Q6ZMB0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
B3GNT6Q6ZMB0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
B3GNT6Q6ZMB0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
B3GNT6Q6ZMB0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
B3GNT6Q6ZMB0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
B3GNT6Q6ZMB0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
B3GNT6Q6ZMB0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
B3GNT6Q6ZMB0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
B3GNT6Q6ZMB0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
B3GNT6Q6ZMB0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
B3GNT6Q6ZMB0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
B3GNT6Q6ZMB0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
B3GNT6Q6ZMB0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
B3GNT6Q6ZMB0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
B3GNT6Q6ZMB0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
B3GNT6Q6ZMB0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
B3GNT6Q6ZMB0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
B3GNT6Q6ZMB0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
B3GNT6Q6ZMB0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
B3GNT6Q6ZMB0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
B3GNT6Q6ZMB0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
B3GNT6Q6ZMB0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
B3GNT6Q6ZMB0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
B3GNT6Q6ZMB0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
B3GNT6Q6ZMB0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
B3GNT6Q6ZMB0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
B3GNT6Q6ZMB0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
B3GNT6Q6ZMB0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
B3GNT6Q6ZMB0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
B3GNT6Q6ZMB0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
B3GNT6Q6ZMB0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
B3GNT6Q6ZMB0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
B3GNT6Q6ZMB0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
B3GNT6Q6ZMB0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
B3GNT6Q6ZMB0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
B3GNT6Q6ZMB0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
B3GNT6Q6ZMB0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
B3GNT6Q6ZMB0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
B3GNT6Q6ZMB0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
B3GNT6Q6ZMB0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
B3GNT6Q6ZMB0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
B3GNT6Q6ZMB0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
B3GNT6Q6ZMB0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
B3GNT6Q6ZMB0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
B3GNT6Q6ZMB0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
B3GNT6Q6ZMB0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
B3GNT6Q6ZMB0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
B3GNT6Q6ZMB0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
B3GNT6Q6ZMB0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
B3GNT6Q6ZMB0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
B3GNT6Q6ZMB0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
B3GNT6Q6ZMB0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
B3GNT6Q6ZMB0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
B3GNT6Q6ZMB0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
B3GNT6Q6ZMB0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
B3GNT6Q6ZMB0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
B3GNT6Q6ZMB0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
B3GNT6Q6ZMB0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
B3GNT6Q6ZMB0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
B3GNT6Q6ZMB0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
B3GNT6Q6ZMB0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
B3GNT6Q6ZMB0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
B3GNT6Q6ZMB0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
B3GNT6Q6ZMB0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms