Protein–RNA interactions for Protein: Q49AG3

ZBED5, Zinc finger BED domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED5Q49AG3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZBED5Q49AG3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZBED5Q49AG3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZBED5Q49AG3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZBED5Q49AG3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZBED5Q49AG3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZBED5Q49AG3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZBED5Q49AG3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZBED5Q49AG3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZBED5Q49AG3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZBED5Q49AG3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZBED5Q49AG3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZBED5Q49AG3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZBED5Q49AG3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZBED5Q49AG3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZBED5Q49AG3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZBED5Q49AG3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZBED5Q49AG3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZBED5Q49AG3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZBED5Q49AG3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZBED5Q49AG3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZBED5Q49AG3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZBED5Q49AG3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZBED5Q49AG3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZBED5Q49AG3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZBED5Q49AG3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZBED5Q49AG3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZBED5Q49AG3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZBED5Q49AG3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZBED5Q49AG3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZBED5Q49AG3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZBED5Q49AG3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZBED5Q49AG3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZBED5Q49AG3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZBED5Q49AG3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZBED5Q49AG3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZBED5Q49AG3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZBED5Q49AG3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZBED5Q49AG3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZBED5Q49AG3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZBED5Q49AG3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZBED5Q49AG3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZBED5Q49AG3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZBED5Q49AG3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZBED5Q49AG3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZBED5Q49AG3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZBED5Q49AG3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZBED5Q49AG3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZBED5Q49AG3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZBED5Q49AG3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZBED5Q49AG3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZBED5Q49AG3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZBED5Q49AG3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ZBED5Q49AG3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZBED5Q49AG3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZBED5Q49AG3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZBED5Q49AG3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZBED5Q49AG3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZBED5Q49AG3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZBED5Q49AG3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZBED5Q49AG3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZBED5Q49AG3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ZBED5Q49AG3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZBED5Q49AG3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ZBED5Q49AG3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZBED5Q49AG3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZBED5Q49AG3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZBED5Q49AG3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZBED5Q49AG3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBED5Q49AG3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZBED5Q49AG3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZBED5Q49AG3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZBED5Q49AG3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZBED5Q49AG3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZBED5Q49AG3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZBED5Q49AG3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZBED5Q49AG3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZBED5Q49AG3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZBED5Q49AG3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZBED5Q49AG3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZBED5Q49AG3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ZBED5Q49AG3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZBED5Q49AG3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZBED5Q49AG3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZBED5Q49AG3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZBED5Q49AG3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZBED5Q49AG3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZBED5Q49AG3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZBED5Q49AG3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZBED5Q49AG3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZBED5Q49AG3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZBED5Q49AG3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZBED5Q49AG3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZBED5Q49AG3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZBED5Q49AG3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZBED5Q49AG3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZBED5Q49AG3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZBED5Q49AG3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZBED5Q49AG3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZBED5Q49AG3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms