Protein–RNA interactions for Protein: Q49AG3

ZBED5, Zinc finger BED domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED5Q49AG3 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
ZBED5Q49AG3 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
ZBED5Q49AG3 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
ZBED5Q49AG3 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ZBED5Q49AG3 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
ZBED5Q49AG3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ZBED5Q49AG3 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ZBED5Q49AG3 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ZBED5Q49AG3 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZBED5Q49AG3 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
ZBED5Q49AG3 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZBED5Q49AG3 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZBED5Q49AG3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ZBED5Q49AG3 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ZBED5Q49AG3 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZBED5Q49AG3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZBED5Q49AG3 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZBED5Q49AG3 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZBED5Q49AG3 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZBED5Q49AG3 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZBED5Q49AG3 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZBED5Q49AG3 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZBED5Q49AG3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZBED5Q49AG3 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZBED5Q49AG3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZBED5Q49AG3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZBED5Q49AG3 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZBED5Q49AG3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZBED5Q49AG3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZBED5Q49AG3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZBED5Q49AG3 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZBED5Q49AG3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZBED5Q49AG3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZBED5Q49AG3 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZBED5Q49AG3 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZBED5Q49AG3 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZBED5Q49AG3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZBED5Q49AG3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZBED5Q49AG3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZBED5Q49AG3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZBED5Q49AG3 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZBED5Q49AG3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZBED5Q49AG3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZBED5Q49AG3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZBED5Q49AG3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZBED5Q49AG3 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZBED5Q49AG3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZBED5Q49AG3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZBED5Q49AG3 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZBED5Q49AG3 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZBED5Q49AG3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZBED5Q49AG3 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZBED5Q49AG3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZBED5Q49AG3 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZBED5Q49AG3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZBED5Q49AG3 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZBED5Q49AG3 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZBED5Q49AG3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZBED5Q49AG3 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZBED5Q49AG3 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZBED5Q49AG3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZBED5Q49AG3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZBED5Q49AG3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZBED5Q49AG3 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ZBED5Q49AG3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ZBED5Q49AG3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ZBED5Q49AG3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ZBED5Q49AG3 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZBED5Q49AG3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZBED5Q49AG3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZBED5Q49AG3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZBED5Q49AG3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZBED5Q49AG3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZBED5Q49AG3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZBED5Q49AG3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZBED5Q49AG3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZBED5Q49AG3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZBED5Q49AG3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZBED5Q49AG3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZBED5Q49AG3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZBED5Q49AG3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZBED5Q49AG3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZBED5Q49AG3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZBED5Q49AG3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZBED5Q49AG3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZBED5Q49AG3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZBED5Q49AG3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZBED5Q49AG3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZBED5Q49AG3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZBED5Q49AG3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZBED5Q49AG3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZBED5Q49AG3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZBED5Q49AG3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZBED5Q49AG3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZBED5Q49AG3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZBED5Q49AG3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZBED5Q49AG3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZBED5Q49AG3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZBED5Q49AG3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZBED5Q49AG3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms