Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC46.83■■■■■ 5.09
FHOD3Q2V2M9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC46.83■■■■■ 5.09
FHOD3Q2V2M9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC46.82■■■■■ 5.09
FHOD3Q2V2M9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC46.82■■■■■ 5.09
FHOD3Q2V2M9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC46.81■■■■■ 5.08
FHOD3Q2V2M9 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.75■■■■■ 5.07
FHOD3Q2V2M9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC46.72■■■■■ 5.07
FHOD3Q2V2M9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC46.71■■■■■ 5.07
FHOD3Q2V2M9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.69■■■■■ 5.06
FHOD3Q2V2M9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.58■■■■■ 5.05
FHOD3Q2V2M9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC46.58■■■■■ 5.05
FHOD3Q2V2M9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.58■■■■■ 5.05
FHOD3Q2V2M9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.49■■■■■ 5.03
FHOD3Q2V2M9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.47■■■■■ 5.03
FHOD3Q2V2M9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.47■■■■■ 5.03
FHOD3Q2V2M9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC46.46■■■■■ 5.03
FHOD3Q2V2M9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.46■■■■■ 5.03
FHOD3Q2V2M9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC46.45■■■■■ 5.03
FHOD3Q2V2M9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.45■■■■■ 5.03
FHOD3Q2V2M9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC46.45■■■■■ 5.03
FHOD3Q2V2M9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC46.44■■■■■ 5.02
FHOD3Q2V2M9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC46.44■■■■■ 5.02
FHOD3Q2V2M9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC46.4■■■■■ 5.02
FHOD3Q2V2M9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.36■■■■■ 5.01
FHOD3Q2V2M9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC46.31■■■■■ 5
FHOD3Q2V2M9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
FHOD3Q2V2M9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.21■■■■■ 4.99
FHOD3Q2V2M9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC46.21■■■■■ 4.99
FHOD3Q2V2M9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.2■■■■■ 4.99
FHOD3Q2V2M9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC46.16■■■■■ 4.98
FHOD3Q2V2M9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.15■■■■■ 4.98
FHOD3Q2V2M9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC46.1■■■■■ 4.97
FHOD3Q2V2M9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC46.1■■■■■ 4.97
FHOD3Q2V2M9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC46.09■■■■■ 4.97
FHOD3Q2V2M9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.07■■■■■ 4.97
FHOD3Q2V2M9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
FHOD3Q2V2M9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC46.02■■■■■ 4.96
FHOD3Q2V2M9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC45.99■■■■■ 4.95
FHOD3Q2V2M9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC45.98■■■■■ 4.95
FHOD3Q2V2M9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC45.97■■■■■ 4.95
FHOD3Q2V2M9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC45.91■■■■■ 4.94
FHOD3Q2V2M9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC45.88■■■■■ 4.94
FHOD3Q2V2M9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.88■■■■■ 4.94
FHOD3Q2V2M9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC45.86■■■■■ 4.93
FHOD3Q2V2M9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC45.84■■■■■ 4.93
FHOD3Q2V2M9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.82■■■■■ 4.93
FHOD3Q2V2M9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC45.82■■■■■ 4.93
FHOD3Q2V2M9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC45.82■■■■■ 4.93
FHOD3Q2V2M9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
FHOD3Q2V2M9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
FHOD3Q2V2M9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
FHOD3Q2V2M9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC45.79■■■■■ 4.92
FHOD3Q2V2M9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC45.78■■■■■ 4.92
FHOD3Q2V2M9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC45.77■■■■■ 4.92
FHOD3Q2V2M9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC45.75■■■■■ 4.91
FHOD3Q2V2M9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC45.73■■■■■ 4.91
FHOD3Q2V2M9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC45.73■■■■■ 4.91
FHOD3Q2V2M9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
FHOD3Q2V2M9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
FHOD3Q2V2M9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC45.71■■■■■ 4.91
FHOD3Q2V2M9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC45.69■■■■■ 4.9
FHOD3Q2V2M9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.66■■■■■ 4.9
FHOD3Q2V2M9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.63■■■■■ 4.9
FHOD3Q2V2M9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC45.62■■■■■ 4.89
FHOD3Q2V2M9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC45.6■■■■■ 4.89
FHOD3Q2V2M9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
FHOD3Q2V2M9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.58■■■■■ 4.89
FHOD3Q2V2M9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC45.49■■■■■ 4.87
FHOD3Q2V2M9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC45.45■■■■■ 4.87
FHOD3Q2V2M9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
FHOD3Q2V2M9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC45.39■■■■■ 4.86
FHOD3Q2V2M9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.86
FHOD3Q2V2M9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
FHOD3Q2V2M9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
FHOD3Q2V2M9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.33■■■■■ 4.85
FHOD3Q2V2M9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
FHOD3Q2V2M9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
FHOD3Q2V2M9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC45.33■■■■■ 4.85
FHOD3Q2V2M9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
FHOD3Q2V2M9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC45.28■■■■■ 4.84
FHOD3Q2V2M9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC45.19■■■■■ 4.83
FHOD3Q2V2M9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC45.18■■■■■ 4.82
FHOD3Q2V2M9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC45.16■■■■■ 4.82
FHOD3Q2V2M9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
FHOD3Q2V2M9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.12■■■■■ 4.81
FHOD3Q2V2M9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
FHOD3Q2V2M9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
FHOD3Q2V2M9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
FHOD3Q2V2M9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.81
FHOD3Q2V2M9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.81
FHOD3Q2V2M9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.07■■■■■ 4.81
FHOD3Q2V2M9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
FHOD3Q2V2M9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC45.05■■■■■ 4.8
FHOD3Q2V2M9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC45.04■■■■■ 4.8
FHOD3Q2V2M9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
FHOD3Q2V2M9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC45■■■■■ 4.79
FHOD3Q2V2M9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC44.99■■■■■ 4.79
FHOD3Q2V2M9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
FHOD3Q2V2M9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.79
FHOD3Q2V2M9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms