Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC55.42■■■■■ 6.46
FHOD3Q2V2M9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC54.53■■■■■ 6.32
FHOD3Q2V2M9 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.96■■■■■ 6.23
FHOD3Q2V2M9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC53.7■■■■■ 6.19
FHOD3Q2V2M9 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.63■■■■■ 6.18
FHOD3Q2V2M9 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC53.41■■■■■ 6.14
FHOD3Q2V2M9 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.35■■■■■ 6.13
FHOD3Q2V2M9 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC53.08■■■■■ 6.09
FHOD3Q2V2M9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.23■■■■■ 5.95
FHOD3Q2V2M9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC52.08■■■■■ 5.93
FHOD3Q2V2M9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC52.02■■■■■ 5.92
FHOD3Q2V2M9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC52■■■■■ 5.92
FHOD3Q2V2M9 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC51.83■■■■■ 5.89
FHOD3Q2V2M9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC51.69■■■■■ 5.87
FHOD3Q2V2M9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.6■■■■■ 5.85
FHOD3Q2V2M9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC51.51■■■■■ 5.84
FHOD3Q2V2M9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC51.46■■■■■ 5.83
FHOD3Q2V2M9 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC51.41■■■■■ 5.82
FHOD3Q2V2M9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.11■■■■■ 5.77
FHOD3Q2V2M9 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC51.05■■■■■ 5.76
FHOD3Q2V2M9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.88■■■■■ 5.73
FHOD3Q2V2M9 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.86■■■■■ 5.73
FHOD3Q2V2M9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.78■■■■■ 5.72
FHOD3Q2V2M9 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC50.69■■■■■ 5.7
FHOD3Q2V2M9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.62■■■■■ 5.69
FHOD3Q2V2M9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC50.62■■■■■ 5.69
FHOD3Q2V2M9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.45■■■■■ 5.67
FHOD3Q2V2M9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC50.4■■■■■ 5.66
FHOD3Q2V2M9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC50.23■■■■■ 5.63
FHOD3Q2V2M9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.02■■■■■ 5.6
FHOD3Q2V2M9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.99■■■■■ 5.59
FHOD3Q2V2M9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.94■■■■■ 5.59
FHOD3Q2V2M9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.86■■■■■ 5.57
FHOD3Q2V2M9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC49.62■■■■■ 5.53
FHOD3Q2V2M9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC49.45■■■■■ 5.51
FHOD3Q2V2M9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC49.44■■■■■ 5.51
FHOD3Q2V2M9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC49.44■■■■■ 5.51
FHOD3Q2V2M9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC49.44■■■■■ 5.5
FHOD3Q2V2M9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC49.39■■■■■ 5.5
FHOD3Q2V2M9 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC49.32■■■■■ 5.49
FHOD3Q2V2M9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC49.27■■■■■ 5.48
FHOD3Q2V2M9 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.18■■■■■ 5.46
FHOD3Q2V2M9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.04■■■■■ 5.44
FHOD3Q2V2M9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.01■■■■■ 5.44
FHOD3Q2V2M9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.96■■■■■ 5.43
FHOD3Q2V2M9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC48.81■■■■■ 5.4
FHOD3Q2V2M9 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.79■■■■■ 5.4
FHOD3Q2V2M9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC48.71■■■■■ 5.39
FHOD3Q2V2M9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC48.63■■■■■ 5.37
FHOD3Q2V2M9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.6■■■■■ 5.37
FHOD3Q2V2M9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC48.32■■■■■ 5.33
FHOD3Q2V2M9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC48.15■■■■■ 5.3
FHOD3Q2V2M9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.13■■■■■ 5.3
FHOD3Q2V2M9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC48.07■■■■■ 5.29
FHOD3Q2V2M9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC48.07■■■■■ 5.28
FHOD3Q2V2M9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC48.06■■■■■ 5.28
FHOD3Q2V2M9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC48.03■■■■■ 5.28
FHOD3Q2V2M9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC48.02■■■■■ 5.28
FHOD3Q2V2M9 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC47.96■■■■■ 5.27
FHOD3Q2V2M9 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC47.88■■■■■ 5.26
FHOD3Q2V2M9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.87■■■■■ 5.25
FHOD3Q2V2M9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.86■■■■■ 5.25
FHOD3Q2V2M9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC47.85■■■■■ 5.25
FHOD3Q2V2M9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC47.83■■■■■ 5.25
FHOD3Q2V2M9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC47.83■■■■■ 5.25
FHOD3Q2V2M9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.8■■■■■ 5.24
FHOD3Q2V2M9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.78■■■■■ 5.24
FHOD3Q2V2M9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC47.75■■■■■ 5.23
FHOD3Q2V2M9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC47.75■■■■■ 5.23
FHOD3Q2V2M9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC47.73■■■■■ 5.23
FHOD3Q2V2M9 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC47.72■■■■■ 5.23
FHOD3Q2V2M9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.7■■■■■ 5.23
FHOD3Q2V2M9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC47.68■■■■■ 5.22
FHOD3Q2V2M9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.66■■■■■ 5.22
FHOD3Q2V2M9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC47.66■■■■■ 5.22
FHOD3Q2V2M9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.6■■■■■ 5.21
FHOD3Q2V2M9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC47.6■■■■■ 5.21
FHOD3Q2V2M9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC47.58■■■■■ 5.21
FHOD3Q2V2M9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.58■■■■■ 5.21
FHOD3Q2V2M9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC47.54■■■■■ 5.2
FHOD3Q2V2M9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.47■■■■■ 5.19
FHOD3Q2V2M9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC47.47■■■■■ 5.19
FHOD3Q2V2M9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.43■■■■■ 5.18
FHOD3Q2V2M9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.42■■■■■ 5.18
FHOD3Q2V2M9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.39■■■■■ 5.18
FHOD3Q2V2M9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC47.39■■■■■ 5.18
FHOD3Q2V2M9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.38■■■■■ 5.18
FHOD3Q2V2M9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.38■■■■■ 5.17
FHOD3Q2V2M9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC47.35■■■■■ 5.17
FHOD3Q2V2M9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC47.35■■■■■ 5.17
FHOD3Q2V2M9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC47.33■■■■■ 5.17
FHOD3Q2V2M9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.29■■■■■ 5.16
FHOD3Q2V2M9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.2■■■■■ 5.15
FHOD3Q2V2M9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.17■■■■■ 5.14
FHOD3Q2V2M9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.12■■■■■ 5.13
FHOD3Q2V2M9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.04■■■■■ 5.12
FHOD3Q2V2M9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC47.04■■■■■ 5.12
FHOD3Q2V2M9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.01■■■■■ 5.12
FHOD3Q2V2M9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.93■■■■■ 5.1
FHOD3Q2V2M9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.92■■■■■ 5.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms