Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CACNA1EQ15878 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CACNA1EQ15878 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CACNA1EQ15878 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CACNA1EQ15878 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CACNA1EQ15878 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CACNA1EQ15878 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CACNA1EQ15878 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CACNA1EQ15878 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CACNA1EQ15878 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CACNA1EQ15878 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CACNA1EQ15878 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CACNA1EQ15878 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CACNA1EQ15878 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CACNA1EQ15878 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CACNA1EQ15878 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CACNA1EQ15878 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CACNA1EQ15878 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CACNA1EQ15878 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CACNA1EQ15878 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CACNA1EQ15878 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CACNA1EQ15878 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CACNA1EQ15878 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CACNA1EQ15878 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CACNA1EQ15878 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CACNA1EQ15878 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CACNA1EQ15878 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CACNA1EQ15878 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CACNA1EQ15878 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CACNA1EQ15878 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CACNA1EQ15878 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CACNA1EQ15878 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CACNA1EQ15878 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
CACNA1EQ15878 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CACNA1EQ15878 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CACNA1EQ15878 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CACNA1EQ15878 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CACNA1EQ15878 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CACNA1EQ15878 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CACNA1EQ15878 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CACNA1EQ15878 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CACNA1EQ15878 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CACNA1EQ15878 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CACNA1EQ15878 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CACNA1EQ15878 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CACNA1EQ15878 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CACNA1EQ15878 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CACNA1EQ15878 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CACNA1EQ15878 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CACNA1EQ15878 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CACNA1EQ15878 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CACNA1EQ15878 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CACNA1EQ15878 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CACNA1EQ15878 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CACNA1EQ15878 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CACNA1EQ15878 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CACNA1EQ15878 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CACNA1EQ15878 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CACNA1EQ15878 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CACNA1EQ15878 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CACNA1EQ15878 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CACNA1EQ15878 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CACNA1EQ15878 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CACNA1EQ15878 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CACNA1EQ15878 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CACNA1EQ15878 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CACNA1EQ15878 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CACNA1EQ15878 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CACNA1EQ15878 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CACNA1EQ15878 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CACNA1EQ15878 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CACNA1EQ15878 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CACNA1EQ15878 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CACNA1EQ15878 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CACNA1EQ15878 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CACNA1EQ15878 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CACNA1EQ15878 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CACNA1EQ15878 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CACNA1EQ15878 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CACNA1EQ15878 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CACNA1EQ15878 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CACNA1EQ15878 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CACNA1EQ15878 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CACNA1EQ15878 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CACNA1EQ15878 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CACNA1EQ15878 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CACNA1EQ15878 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CACNA1EQ15878 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CACNA1EQ15878 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CACNA1EQ15878 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CACNA1EQ15878 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CACNA1EQ15878 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CACNA1EQ15878 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CACNA1EQ15878 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CACNA1EQ15878 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CACNA1EQ15878 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CACNA1EQ15878 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CACNA1EQ15878 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CACNA1EQ15878 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CACNA1EQ15878 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms