Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CACNB3P54284 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CACNB3P54284 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CACNB3P54284 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CACNB3P54284 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CACNB3P54284 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CACNB3P54284 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CACNB3P54284 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CACNB3P54284 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CACNB3P54284 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CACNB3P54284 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CACNB3P54284 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CACNB3P54284 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.17
CACNB3P54284 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CACNB3P54284 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CACNB3P54284 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CACNB3P54284 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CACNB3P54284 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CACNB3P54284 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CACNB3P54284 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CACNB3P54284 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CACNB3P54284 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CACNB3P54284 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CACNB3P54284 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CACNB3P54284 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CACNB3P54284 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CACNB3P54284 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CACNB3P54284 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
CACNB3P54284 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CACNB3P54284 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CACNB3P54284 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CACNB3P54284 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CACNB3P54284 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CACNB3P54284 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CACNB3P54284 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CACNB3P54284 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CACNB3P54284 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CACNB3P54284 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CACNB3P54284 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CACNB3P54284 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CACNB3P54284 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CACNB3P54284 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CACNB3P54284 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CACNB3P54284 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
CACNB3P54284 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CACNB3P54284 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CACNB3P54284 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CACNB3P54284 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CACNB3P54284 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CACNB3P54284 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CACNB3P54284 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
CACNB3P54284 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
CACNB3P54284 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CACNB3P54284 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CACNB3P54284 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CACNB3P54284 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
CACNB3P54284 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CACNB3P54284 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CACNB3P54284 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CACNB3P54284 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CACNB3P54284 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CACNB3P54284 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CACNB3P54284 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CACNB3P54284 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CACNB3P54284 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
CACNB3P54284 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CACNB3P54284 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CACNB3P54284 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CACNB3P54284 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CACNB3P54284 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CACNB3P54284 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CACNB3P54284 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CACNB3P54284 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CACNB3P54284 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CACNB3P54284 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CACNB3P54284 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CACNB3P54284 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CACNB3P54284 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CACNB3P54284 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CACNB3P54284 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
CACNB3P54284 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CACNB3P54284 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CACNB3P54284 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CACNB3P54284 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CACNB3P54284 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC33.79■■■■□ 3
CACNB3P54284 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CACNB3P54284 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CACNB3P54284 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CACNB3P54284 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CACNB3P54284 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CACNB3P54284 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CACNB3P54284 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CACNB3P54284 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CACNB3P54284 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CACNB3P54284 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CACNB3P54284 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CACNB3P54284 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CACNB3P54284 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CACNB3P54284 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CACNB3P54284 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms