Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC41.48■■■■■ 4.23
CACNB3P54284 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC40.69■■■■■ 4.1
CACNB3P54284 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
CACNB3P54284 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.11■■■■■ 4.01
CACNB3P54284 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
CACNB3P54284 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
CACNB3P54284 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
CACNB3P54284 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC39.75■■■■□ 3.95
CACNB3P54284 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
CACNB3P54284 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
CACNB3P54284 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC38.86■■■■□ 3.81
CACNB3P54284 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC38.81■■■■□ 3.8
CACNB3P54284 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
CACNB3P54284 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
CACNB3P54284 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CACNB3P54284 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
CACNB3P54284 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CACNB3P54284 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CACNB3P54284 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
CACNB3P54284 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
CACNB3P54284 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
CACNB3P54284 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
CACNB3P54284 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
CACNB3P54284 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
CACNB3P54284 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
CACNB3P54284 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
CACNB3P54284 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
CACNB3P54284 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
CACNB3P54284 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
CACNB3P54284 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
CACNB3P54284 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
CACNB3P54284 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
CACNB3P54284 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CACNB3P54284 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
CACNB3P54284 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC37■■■■□ 3.51
CACNB3P54284 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
CACNB3P54284 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
CACNB3P54284 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
CACNB3P54284 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
CACNB3P54284 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
CACNB3P54284 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CACNB3P54284 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CACNB3P54284 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CACNB3P54284 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CACNB3P54284 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CACNB3P54284 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
CACNB3P54284 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CACNB3P54284 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CACNB3P54284 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CACNB3P54284 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CACNB3P54284 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CACNB3P54284 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
CACNB3P54284 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
CACNB3P54284 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CACNB3P54284 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CACNB3P54284 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CACNB3P54284 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CACNB3P54284 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CACNB3P54284 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CACNB3P54284 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CACNB3P54284 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CACNB3P54284 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CACNB3P54284 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CACNB3P54284 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CACNB3P54284 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CACNB3P54284 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CACNB3P54284 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CACNB3P54284 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
CACNB3P54284 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CACNB3P54284 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CACNB3P54284 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CACNB3P54284 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CACNB3P54284 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CACNB3P54284 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CACNB3P54284 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CACNB3P54284 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CACNB3P54284 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
CACNB3P54284 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CACNB3P54284 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CACNB3P54284 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CACNB3P54284 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CACNB3P54284 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CACNB3P54284 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CACNB3P54284 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CACNB3P54284 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
CACNB3P54284 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CACNB3P54284 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CACNB3P54284 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CACNB3P54284 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CACNB3P54284 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CACNB3P54284 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.26
CACNB3P54284 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CACNB3P54284 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CACNB3P54284 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CACNB3P54284 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
CACNB3P54284 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
CACNB3P54284 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CACNB3P54284 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CACNB3P54284 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CACNB3P54284 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms