Protein–RNA interactions for Protein: P49418

AMPH, Amphiphysin, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPHP49418 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
AMPHP49418 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
AMPHP49418 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
AMPHP49418 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
AMPHP49418 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC39.31■■■■□ 3.88
AMPHP49418 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
AMPHP49418 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
AMPHP49418 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC39.22■■■■□ 3.87
AMPHP49418 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
AMPHP49418 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC39.17■■■■□ 3.86
AMPHP49418 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
AMPHP49418 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
AMPHP49418 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
AMPHP49418 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
AMPHP49418 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
AMPHP49418 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
AMPHP49418 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC39.04■■■■□ 3.84
AMPHP49418 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
AMPHP49418 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC39.02■■■■□ 3.84
AMPHP49418 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
AMPHP49418 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC38.98■■■■□ 3.83
AMPHP49418 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
AMPHP49418 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
AMPHP49418 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC38.93■■■■□ 3.82
AMPHP49418 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
AMPHP49418 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
AMPHP49418 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
AMPHP49418 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
AMPHP49418 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.8
AMPHP49418 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.8
AMPHP49418 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC38.81■■■■□ 3.8
AMPHP49418 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
AMPHP49418 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
AMPHP49418 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.8
AMPHP49418 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
AMPHP49418 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
AMPHP49418 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
AMPHP49418 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
AMPHP49418 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC38.65■■■■□ 3.78
AMPHP49418 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
AMPHP49418 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
AMPHP49418 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
AMPHP49418 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
AMPHP49418 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
AMPHP49418 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC38.58■■■■□ 3.77
AMPHP49418 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.76
AMPHP49418 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
AMPHP49418 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
AMPHP49418 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
AMPHP49418 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC38.52■■■■□ 3.76
AMPHP49418 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
AMPHP49418 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
AMPHP49418 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
AMPHP49418 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
AMPHP49418 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
AMPHP49418 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
AMPHP49418 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
AMPHP49418 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC38.4■■■■□ 3.74
AMPHP49418 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
AMPHP49418 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
AMPHP49418 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
AMPHP49418 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
AMPHP49418 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
AMPHP49418 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
AMPHP49418 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
AMPHP49418 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
AMPHP49418 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
AMPHP49418 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
AMPHP49418 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
AMPHP49418 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
AMPHP49418 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
AMPHP49418 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC38.17■■■■□ 3.7
AMPHP49418 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
AMPHP49418 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
AMPHP49418 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
AMPHP49418 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
AMPHP49418 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
AMPHP49418 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
AMPHP49418 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC38.05■■■■□ 3.68
AMPHP49418 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
AMPHP49418 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
AMPHP49418 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
AMPHP49418 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
AMPHP49418 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC37.99■■■■□ 3.67
AMPHP49418 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
AMPHP49418 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
AMPHP49418 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
AMPHP49418 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
AMPHP49418 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
AMPHP49418 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.92■■■■□ 3.66
AMPHP49418 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
AMPHP49418 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
AMPHP49418 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
AMPHP49418 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
AMPHP49418 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
AMPHP49418 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
AMPHP49418 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
AMPHP49418 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
AMPHP49418 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
AMPHP49418 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms