Protein–RNA interactions for Protein: P05813

CRYBA1, Beta-crystallin A3, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBA1P05813 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CRYBA1P05813 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRYBA1P05813 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRYBA1P05813 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRYBA1P05813 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRYBA1P05813 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CRYBA1P05813 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CRYBA1P05813 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CRYBA1P05813 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRYBA1P05813 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRYBA1P05813 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRYBA1P05813 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRYBA1P05813 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRYBA1P05813 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRYBA1P05813 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRYBA1P05813 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRYBA1P05813 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRYBA1P05813 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRYBA1P05813 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRYBA1P05813 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRYBA1P05813 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRYBA1P05813 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRYBA1P05813 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRYBA1P05813 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRYBA1P05813 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRYBA1P05813 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRYBA1P05813 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRYBA1P05813 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRYBA1P05813 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRYBA1P05813 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRYBA1P05813 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CRYBA1P05813 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRYBA1P05813 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRYBA1P05813 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRYBA1P05813 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRYBA1P05813 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRYBA1P05813 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRYBA1P05813 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRYBA1P05813 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRYBA1P05813 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRYBA1P05813 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRYBA1P05813 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRYBA1P05813 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRYBA1P05813 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRYBA1P05813 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRYBA1P05813 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRYBA1P05813 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRYBA1P05813 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRYBA1P05813 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRYBA1P05813 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CRYBA1P05813 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRYBA1P05813 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRYBA1P05813 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRYBA1P05813 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRYBA1P05813 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRYBA1P05813 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRYBA1P05813 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRYBA1P05813 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRYBA1P05813 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRYBA1P05813 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRYBA1P05813 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRYBA1P05813 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRYBA1P05813 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRYBA1P05813 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRYBA1P05813 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRYBA1P05813 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRYBA1P05813 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRYBA1P05813 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CRYBA1P05813 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CRYBA1P05813 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRYBA1P05813 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRYBA1P05813 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CRYBA1P05813 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRYBA1P05813 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRYBA1P05813 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRYBA1P05813 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRYBA1P05813 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRYBA1P05813 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRYBA1P05813 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRYBA1P05813 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRYBA1P05813 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRYBA1P05813 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRYBA1P05813 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRYBA1P05813 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRYBA1P05813 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRYBA1P05813 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRYBA1P05813 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRYBA1P05813 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CRYBA1P05813 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRYBA1P05813 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRYBA1P05813 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRYBA1P05813 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRYBA1P05813 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRYBA1P05813 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRYBA1P05813 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRYBA1P05813 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRYBA1P05813 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRYBA1P05813 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRYBA1P05813 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRYBA1P05813 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms