Protein–RNA interactions for Protein: O75954

TSPAN9, Tetraspanin-9, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN9O75954 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN9O75954 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN9O75954 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN9O75954 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSPAN9O75954 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSPAN9O75954 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSPAN9O75954 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN9O75954 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN9O75954 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN9O75954 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSPAN9O75954 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN9O75954 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TSPAN9O75954 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSPAN9O75954 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN9O75954 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSPAN9O75954 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN9O75954 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN9O75954 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN9O75954 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN9O75954 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN9O75954 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TSPAN9O75954 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN9O75954 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN9O75954 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN9O75954 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN9O75954 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TSPAN9O75954 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSPAN9O75954 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSPAN9O75954 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSPAN9O75954 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSPAN9O75954 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSPAN9O75954 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSPAN9O75954 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSPAN9O75954 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSPAN9O75954 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSPAN9O75954 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TSPAN9O75954 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSPAN9O75954 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSPAN9O75954 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSPAN9O75954 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSPAN9O75954 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSPAN9O75954 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSPAN9O75954 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSPAN9O75954 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSPAN9O75954 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSPAN9O75954 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSPAN9O75954 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSPAN9O75954 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSPAN9O75954 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSPAN9O75954 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSPAN9O75954 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSPAN9O75954 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSPAN9O75954 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSPAN9O75954 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSPAN9O75954 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSPAN9O75954 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TSPAN9O75954 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSPAN9O75954 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN9O75954 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSPAN9O75954 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSPAN9O75954 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSPAN9O75954 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TSPAN9O75954 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSPAN9O75954 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN9O75954 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSPAN9O75954 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN9O75954 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSPAN9O75954 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSPAN9O75954 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN9O75954 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN9O75954 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
TSPAN9O75954 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN9O75954 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN9O75954 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN9O75954 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN9O75954 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN9O75954 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN9O75954 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN9O75954 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN9O75954 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN9O75954 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN9O75954 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSPAN9O75954 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN9O75954 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN9O75954 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN9O75954 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN9O75954 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSPAN9O75954 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSPAN9O75954 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSPAN9O75954 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TSPAN9O75954 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TSPAN9O75954 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSPAN9O75954 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSPAN9O75954 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSPAN9O75954 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSPAN9O75954 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN9O75954 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN9O75954 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSPAN9O75954 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSPAN9O75954 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms