Protein–RNA interactions for Protein: O75954

TSPAN9, Tetraspanin-9, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN9O75954 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TSPAN9O75954 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TSPAN9O75954 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TSPAN9O75954 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TSPAN9O75954 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TSPAN9O75954 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TSPAN9O75954 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TSPAN9O75954 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TSPAN9O75954 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TSPAN9O75954 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TSPAN9O75954 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSPAN9O75954 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TSPAN9O75954 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TSPAN9O75954 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TSPAN9O75954 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TSPAN9O75954 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TSPAN9O75954 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TSPAN9O75954 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TSPAN9O75954 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TSPAN9O75954 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TSPAN9O75954 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSPAN9O75954 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TSPAN9O75954 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TSPAN9O75954 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSPAN9O75954 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSPAN9O75954 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSPAN9O75954 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TSPAN9O75954 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSPAN9O75954 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSPAN9O75954 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSPAN9O75954 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSPAN9O75954 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSPAN9O75954 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSPAN9O75954 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSPAN9O75954 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSPAN9O75954 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSPAN9O75954 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSPAN9O75954 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSPAN9O75954 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSPAN9O75954 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSPAN9O75954 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSPAN9O75954 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSPAN9O75954 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSPAN9O75954 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSPAN9O75954 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSPAN9O75954 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSPAN9O75954 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSPAN9O75954 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSPAN9O75954 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TSPAN9O75954 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSPAN9O75954 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSPAN9O75954 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSPAN9O75954 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSPAN9O75954 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TSPAN9O75954 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSPAN9O75954 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSPAN9O75954 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSPAN9O75954 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSPAN9O75954 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSPAN9O75954 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSPAN9O75954 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSPAN9O75954 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSPAN9O75954 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSPAN9O75954 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSPAN9O75954 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSPAN9O75954 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSPAN9O75954 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSPAN9O75954 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSPAN9O75954 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSPAN9O75954 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSPAN9O75954 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSPAN9O75954 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSPAN9O75954 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSPAN9O75954 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSPAN9O75954 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSPAN9O75954 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TSPAN9O75954 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSPAN9O75954 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSPAN9O75954 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSPAN9O75954 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSPAN9O75954 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSPAN9O75954 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPAN9O75954 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSPAN9O75954 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TSPAN9O75954 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN9O75954 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN9O75954 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN9O75954 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN9O75954 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSPAN9O75954 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSPAN9O75954 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN9O75954 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSPAN9O75954 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSPAN9O75954 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSPAN9O75954 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSPAN9O75954 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN9O75954 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN9O75954 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN9O75954 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN9O75954 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms