Protein–RNA interactions for Protein: O75808

CAPN15, Calpain-15, humanhuman

Predictions only

Length 1,086 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN15O75808 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
CAPN15O75808 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CAPN15O75808 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
CAPN15O75808 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CAPN15O75808 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
CAPN15O75808 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CAPN15O75808 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
CAPN15O75808 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CAPN15O75808 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
CAPN15O75808 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CAPN15O75808 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CAPN15O75808 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CAPN15O75808 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CAPN15O75808 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CAPN15O75808 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
CAPN15O75808 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CAPN15O75808 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
CAPN15O75808 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CAPN15O75808 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CAPN15O75808 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CAPN15O75808 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CAPN15O75808 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CAPN15O75808 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CAPN15O75808 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CAPN15O75808 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CAPN15O75808 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CAPN15O75808 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CAPN15O75808 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CAPN15O75808 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CAPN15O75808 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CAPN15O75808 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CAPN15O75808 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CAPN15O75808 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CAPN15O75808 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CAPN15O75808 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CAPN15O75808 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CAPN15O75808 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CAPN15O75808 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CAPN15O75808 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CAPN15O75808 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CAPN15O75808 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CAPN15O75808 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CAPN15O75808 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CAPN15O75808 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
CAPN15O75808 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CAPN15O75808 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CAPN15O75808 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CAPN15O75808 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CAPN15O75808 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CAPN15O75808 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CAPN15O75808 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CAPN15O75808 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CAPN15O75808 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
CAPN15O75808 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CAPN15O75808 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CAPN15O75808 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CAPN15O75808 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CAPN15O75808 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CAPN15O75808 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CAPN15O75808 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CAPN15O75808 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CAPN15O75808 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CAPN15O75808 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CAPN15O75808 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CAPN15O75808 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CAPN15O75808 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CAPN15O75808 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CAPN15O75808 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CAPN15O75808 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CAPN15O75808 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CAPN15O75808 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
CAPN15O75808 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CAPN15O75808 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CAPN15O75808 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CAPN15O75808 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CAPN15O75808 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CAPN15O75808 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CAPN15O75808 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CAPN15O75808 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CAPN15O75808 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CAPN15O75808 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CAPN15O75808 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CAPN15O75808 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CAPN15O75808 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
CAPN15O75808 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CAPN15O75808 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
CAPN15O75808 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
CAPN15O75808 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
CAPN15O75808 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CAPN15O75808 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
CAPN15O75808 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CAPN15O75808 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CAPN15O75808 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CAPN15O75808 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CAPN15O75808 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CAPN15O75808 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
CAPN15O75808 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CAPN15O75808 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CAPN15O75808 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CAPN15O75808 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms