Protein–RNA interactions for Protein: O75808

CAPN15, Calpain-15, humanhuman

Predictions only

Length 1,086 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN15O75808 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC40.36■■■■■ 4.05
CAPN15O75808 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.21■■■■■ 4.03
CAPN15O75808 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
CAPN15O75808 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
CAPN15O75808 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
CAPN15O75808 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
CAPN15O75808 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.81■■■■□ 3.8
CAPN15O75808 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC38.67■■■■□ 3.78
CAPN15O75808 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
CAPN15O75808 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
CAPN15O75808 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
CAPN15O75808 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
CAPN15O75808 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
CAPN15O75808 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
CAPN15O75808 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC37.76■■■■□ 3.64
CAPN15O75808 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
CAPN15O75808 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC37.54■■■■□ 3.6
CAPN15O75808 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
CAPN15O75808 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CAPN15O75808 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
CAPN15O75808 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
CAPN15O75808 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
CAPN15O75808 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CAPN15O75808 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
CAPN15O75808 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CAPN15O75808 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CAPN15O75808 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
CAPN15O75808 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CAPN15O75808 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
CAPN15O75808 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
CAPN15O75808 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CAPN15O75808 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CAPN15O75808 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CAPN15O75808 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CAPN15O75808 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
CAPN15O75808 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CAPN15O75808 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CAPN15O75808 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CAPN15O75808 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CAPN15O75808 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CAPN15O75808 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CAPN15O75808 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CAPN15O75808 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CAPN15O75808 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
CAPN15O75808 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
CAPN15O75808 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CAPN15O75808 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CAPN15O75808 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
CAPN15O75808 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CAPN15O75808 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CAPN15O75808 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CAPN15O75808 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CAPN15O75808 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CAPN15O75808 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CAPN15O75808 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CAPN15O75808 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
CAPN15O75808 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CAPN15O75808 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CAPN15O75808 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CAPN15O75808 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CAPN15O75808 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CAPN15O75808 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CAPN15O75808 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CAPN15O75808 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CAPN15O75808 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CAPN15O75808 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CAPN15O75808 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CAPN15O75808 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CAPN15O75808 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CAPN15O75808 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CAPN15O75808 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CAPN15O75808 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CAPN15O75808 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CAPN15O75808 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CAPN15O75808 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CAPN15O75808 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
CAPN15O75808 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
CAPN15O75808 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CAPN15O75808 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CAPN15O75808 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CAPN15O75808 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
CAPN15O75808 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CAPN15O75808 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
CAPN15O75808 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CAPN15O75808 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CAPN15O75808 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CAPN15O75808 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CAPN15O75808 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CAPN15O75808 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CAPN15O75808 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CAPN15O75808 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CAPN15O75808 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
CAPN15O75808 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CAPN15O75808 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
CAPN15O75808 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
CAPN15O75808 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CAPN15O75808 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
CAPN15O75808 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CAPN15O75808 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CAPN15O75808 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms