Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms