Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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