Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.35■■■■□ 3.73
ECM1Q16610 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
ECM1Q16610 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
ECM1Q16610 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
ECM1Q16610 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
ECM1Q16610 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
ECM1Q16610 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
ECM1Q16610 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
ECM1Q16610 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
ECM1Q16610 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
ECM1Q16610 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
ECM1Q16610 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
ECM1Q16610 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
ECM1Q16610 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
ECM1Q16610 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
ECM1Q16610 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
ECM1Q16610 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
ECM1Q16610 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
ECM1Q16610 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
ECM1Q16610 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.2■■■■□ 3.23
ECM1Q16610 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ECM1Q16610 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
ECM1Q16610 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
ECM1Q16610 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
ECM1Q16610 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
ECM1Q16610 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
ECM1Q16610 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
ECM1Q16610 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ECM1Q16610 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
ECM1Q16610 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
ECM1Q16610 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ECM1Q16610 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
ECM1Q16610 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
ECM1Q16610 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ECM1Q16610 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ECM1Q16610 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ECM1Q16610 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ECM1Q16610 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ECM1Q16610 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ECM1Q16610 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ECM1Q16610 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ECM1Q16610 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ECM1Q16610 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ECM1Q16610 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
ECM1Q16610 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ECM1Q16610 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ECM1Q16610 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ECM1Q16610 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ECM1Q16610 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
ECM1Q16610 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ECM1Q16610 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ECM1Q16610 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ECM1Q16610 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ECM1Q16610 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
ECM1Q16610 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ECM1Q16610 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ECM1Q16610 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ECM1Q16610 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ECM1Q16610 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ECM1Q16610 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ECM1Q16610 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
ECM1Q16610 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
ECM1Q16610 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
ECM1Q16610 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ECM1Q16610 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ECM1Q16610 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ECM1Q16610 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ECM1Q16610 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ECM1Q16610 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
ECM1Q16610 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ECM1Q16610 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ECM1Q16610 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
ECM1Q16610 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ECM1Q16610 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ECM1Q16610 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
ECM1Q16610 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ECM1Q16610 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ECM1Q16610 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ECM1Q16610 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
ECM1Q16610 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
ECM1Q16610 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
ECM1Q16610 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
ECM1Q16610 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ECM1Q16610 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ECM1Q16610 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ECM1Q16610 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
ECM1Q16610 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ECM1Q16610 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ECM1Q16610 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
ECM1Q16610 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ECM1Q16610 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ECM1Q16610 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ECM1Q16610 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ECM1Q16610 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ECM1Q16610 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
ECM1Q16610 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
ECM1Q16610 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ECM1Q16610 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ECM1Q16610 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ECM1Q16610 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
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