Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 FN1-201ENST00000323926 8708 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 AR-208ENST00000612452 10676 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 HS3ST1-201ENST00000002596 8031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 SLX4-201ENST00000294008 7307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms