Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 MEF2D-204ENST00000464356 5598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 LINC00869-206ENST00000610578 5734 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 ZNF331-201ENST00000253144 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 VPS13A-204ENST00000376634 10269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 GPC4-201ENST00000370828 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 DGCR5-203ENST00000438934 5492 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 NQO2-205ENST00000380455 10084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 TNRC6C-205ENST00000588061 8419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 CLPX-201ENST00000300107 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 SRGAP3-202ENST00000383836 8656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 ZNF407-201ENST00000299687 7948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 RTL10-201ENST00000328554 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 TNRC6C-207ENST00000588847 8527 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms