Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP1Q9UPQ3 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms