Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms