Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CCDC88CQ9P219 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CCDC88CQ9P219 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
CCDC88CQ9P219 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CCDC88CQ9P219 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CCDC88CQ9P219 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
CCDC88CQ9P219 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CCDC88CQ9P219 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC88CQ9P219 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CCDC88CQ9P219 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC88CQ9P219 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC88CQ9P219 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CCDC88CQ9P219 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC88CQ9P219 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CCDC88CQ9P219 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
CCDC88CQ9P219 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC88CQ9P219 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC88CQ9P219 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC88CQ9P219 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC88CQ9P219 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC88CQ9P219 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC88CQ9P219 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC88CQ9P219 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC88CQ9P219 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CCDC88CQ9P219 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC88CQ9P219 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC88CQ9P219 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC88CQ9P219 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC88CQ9P219 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC88CQ9P219 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC88CQ9P219 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.28
CCDC88CQ9P219 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC88CQ9P219 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC88CQ9P219 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC88CQ9P219 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC88CQ9P219 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC88CQ9P219 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC88CQ9P219 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC88CQ9P219 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC88CQ9P219 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC88CQ9P219 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC88CQ9P219 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC88CQ9P219 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC88CQ9P219 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC88CQ9P219 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC88CQ9P219 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC88CQ9P219 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC88CQ9P219 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC88CQ9P219 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC88CQ9P219 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC88CQ9P219 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC88CQ9P219 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC88CQ9P219 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC88CQ9P219 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC88CQ9P219 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC88CQ9P219 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC88CQ9P219 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC88CQ9P219 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC88CQ9P219 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC88CQ9P219 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC88CQ9P219 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC88CQ9P219 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC88CQ9P219 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC88CQ9P219 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC88CQ9P219 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC88CQ9P219 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC88CQ9P219 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC88CQ9P219 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC88CQ9P219 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC88CQ9P219 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
CCDC88CQ9P219 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC88CQ9P219 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC88CQ9P219 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC88CQ9P219 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC88CQ9P219 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC88CQ9P219 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC88CQ9P219 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC88CQ9P219 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC88CQ9P219 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC88CQ9P219 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC88CQ9P219 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC88CQ9P219 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC88CQ9P219 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC88CQ9P219 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC88CQ9P219 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC88CQ9P219 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC88CQ9P219 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC88CQ9P219 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC88CQ9P219 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC88CQ9P219 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC88CQ9P219 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC88CQ9P219 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC88CQ9P219 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC88CQ9P219 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC88CQ9P219 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC88CQ9P219 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC88CQ9P219 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC88CQ9P219 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC88CQ9P219 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC88CQ9P219 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms