Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 CCAR2-206ENST00000520861 3560 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 NHSL2-202ENST00000510661 3082 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 TP53I11-203ENST00000395648 3381 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 RGL4-201ENST00000290691 2885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 MAP1S-202ENST00000544059 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 GDPD5-202ENST00000443276 3106 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 AC009084.2-201ENST00000624046 2810 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 AC243964.3-201ENST00000623022 2028 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms