Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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