Protein–RNA interactions for Protein: O95343

SIX3, Homeobox protein SIX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3O95343 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX3O95343 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX3O95343 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX3O95343 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX3O95343 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX3O95343 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX3O95343 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX3O95343 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX3O95343 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX3O95343 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX3O95343 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX3O95343 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX3O95343 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX3O95343 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX3O95343 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX3O95343 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX3O95343 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX3O95343 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX3O95343 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX3O95343 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX3O95343 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX3O95343 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX3O95343 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX3O95343 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX3O95343 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX3O95343 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX3O95343 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX3O95343 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX3O95343 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX3O95343 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX3O95343 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX3O95343 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX3O95343 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX3O95343 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX3O95343 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX3O95343 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX3O95343 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX3O95343 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX3O95343 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX3O95343 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SIX3O95343 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SIX3O95343 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SIX3O95343 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SIX3O95343 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SIX3O95343 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SIX3O95343 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SIX3O95343 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SIX3O95343 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SIX3O95343 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SIX3O95343 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SIX3O95343 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SIX3O95343 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX3O95343 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX3O95343 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX3O95343 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX3O95343 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX3O95343 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX3O95343 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX3O95343 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX3O95343 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX3O95343 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX3O95343 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX3O95343 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX3O95343 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX3O95343 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX3O95343 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX3O95343 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX3O95343 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX3O95343 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX3O95343 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX3O95343 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX3O95343 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX3O95343 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX3O95343 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX3O95343 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX3O95343 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX3O95343 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX3O95343 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX3O95343 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX3O95343 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX3O95343 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX3O95343 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX3O95343 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX3O95343 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX3O95343 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX3O95343 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX3O95343 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX3O95343 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX3O95343 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX3O95343 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX3O95343 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX3O95343 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX3O95343 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX3O95343 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX3O95343 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX3O95343 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX3O95343 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX3O95343 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX3O95343 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX3O95343 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms