RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544999.2

HOXD8-204, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,235 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-204ENST00000544999 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.69■■■■■ 4.26
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HOXD8-204ENST00000544999 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.17■■■■□ 3.22
HOXD8-204ENST00000544999 NACADO15069 1562 aa35.06■■■■□ 3.2
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HOXD8-204ENST00000544999 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.77■■■■□ 3.16
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HOXD8-204ENST00000544999 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.5■■■■□ 3.11
HOXD8-204ENST00000544999 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.36■■■■□ 3.09
HOXD8-204ENST00000544999 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.18■■■■□ 3.06
HOXD8-204ENST00000544999 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.1■■■■□ 3.05
HOXD8-204ENST00000544999 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.9■■■■□ 3.02
HOXD8-204ENST00000544999 SCRIBQ14160 1630 aa33.9■■■■□ 3.02
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HOXD8-204ENST00000544999 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.23■■■□□ 2.91
HOXD8-204ENST00000544999 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.17■■■□□ 2.9
HOXD8-204ENST00000544999 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.99■■■□□ 2.87
HOXD8-204ENST00000544999 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP32.59■■■□□ 2.81
HOXD8-204ENST00000544999 SMARCA4P51532 1647 aa32.41■■■□□ 2.78
HOXD8-204ENST00000544999 NCAPD3P42695 1498 aa32.35■■■□□ 2.77
HOXD8-204ENST00000544999 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.33■■■□□ 2.77
HOXD8-204ENST00000544999 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.31■■■□□ 2.76
HOXD8-204ENST00000544999 SMARCA2P51531 1590 aa32.27■■■□□ 2.76
HOXD8-204ENST00000544999 HMGXB3Q12766 1538 aa32.17■■■□□ 2.74
HOXD8-204ENST00000544999 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.11■■■□□ 2.73
HOXD8-204ENST00000544999 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.11■■■□□ 2.73
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HOXD8-204ENST00000544999 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.55■■■□□ 2.64
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HOXD8-204ENST00000544999 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.38■■■□□ 2.61
HOXD8-204ENST00000544999 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.33■■■□□ 2.61
HOXD8-204ENST00000544999 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.27■■■□□ 2.6
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HOXD8-204ENST00000544999 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.03■■■□□ 2.56
HOXD8-204ENST00000544999 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.02■■■□□ 2.56
HOXD8-204ENST00000544999 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.01■■■□□ 2.56
HOXD8-204ENST00000544999 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.01■■■□□ 2.55
HOXD8-204ENST00000544999 WDR62O43379 1518 aa30.95■■■□□ 2.55
HOXD8-204ENST00000544999 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.94■■■□□ 2.54
HOXD8-204ENST00000544999 PRDM2Q13029 1718 aa30.9■■■□□ 2.54
HOXD8-204ENST00000544999 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.8■■■□□ 2.52
HOXD8-204ENST00000544999 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.72■■■□□ 2.51
HOXD8-204ENST00000544999 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
HOXD8-204ENST00000544999 TOPBP1Q92547 1522 aa30.49■■■□□ 2.47
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HOXD8-204ENST00000544999 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.03■■■□□ 2.4
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HOXD8-204ENST00000544999 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
HOXD8-204ENST00000544999 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.84■■■□□ 2.37
HOXD8-204ENST00000544999 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.82■■■□□ 2.36
HOXD8-204ENST00000544999 TOP2BQ02880 1626 aa29.82■■■□□ 2.36
HOXD8-204ENST00000544999 CHD1O14646 1710 aa29.81■■■□□ 2.36
HOXD8-204ENST00000544999 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.8■■■□□ 2.36
HOXD8-204ENST00000544999 SYNJ1O43426 1573 aa29.77■■■□□ 2.36
HOXD8-204ENST00000544999 GRIN2BQ13224 1484 aa29.77■■■□□ 2.36
HOXD8-204ENST00000544999 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.77■■■□□ 2.36
HOXD8-204ENST00000544999 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
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HOXD8-204ENST00000544999 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.71■■■□□ 2.35
HOXD8-204ENST00000544999 PBRM1Q86U86 1689 aa29.7■■■□□ 2.35
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HOXD8-204ENST00000544999 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.62■■■□□ 2.33
HOXD8-204ENST00000544999 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.62■■■□□ 2.33
HOXD8-204ENST00000544999 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.62■■■□□ 2.33
HOXD8-204ENST00000544999 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
HOXD8-204ENST00000544999 SYNJ2O15056 1496 aa29.61■■■□□ 2.33
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HOXD8-204ENST00000544999 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.49■■■□□ 2.31
HOXD8-204ENST00000544999 ADAMTS12P58397 1594 aa29.44■■■□□ 2.3
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HOXD8-204ENST00000544999 ARAP1Q96P48 1450 aa29.32■■■□□ 2.28
HOXD8-204ENST00000544999 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.29■■■□□ 2.28
HOXD8-204ENST00000544999 NUP160Q12769 1436 aa29.28■■■□□ 2.28
HOXD8-204ENST00000544999 CEP170Q5SW79 1584 aa29.25■■■□□ 2.27
HOXD8-204ENST00000544999 KIF27Q86VH2 1401 aa29.24■■■□□ 2.27
HOXD8-204ENST00000544999 IGF1RP08069 1367 aa29.14■■■□□ 2.26
HOXD8-204ENST00000544999 CUL7Q14999 1698 aa29.12■■■□□ 2.25
HOXD8-204ENST00000544999 SHROOM2Q13796 1616 aa29.09■■■□□ 2.25
HOXD8-204ENST00000544999 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.04■■■□□ 2.24
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