Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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CNIH4Q9P003 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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CNIH4Q9P003 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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CNIH4Q9P003 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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CNIH4Q9P003 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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CNIH4Q9P003 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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CNIH4Q9P003 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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