Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH17Q12864 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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